61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0324 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1709  transposase  100 
 
 
217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1679  transposase  100 
 
 
217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0642  insertion element IS1016 transposase  100 
 
 
217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0324  IS1016C2 transposase  100 
 
 
217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00443664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1116  transposase  99.54 
 
 
217 aa  448  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.651522  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2140  Transposase-like protein  49.46 
 
 
279 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1332  Transposase-like protein  49.46 
 
 
279 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.138478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1232  Transposase-like protein  49.46 
 
 
279 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1375  putative insertion element IS1016 transposase  29.52 
 
 
218 aa  95.1  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0919  hypothetical protein  29.81 
 
 
311 aa  92.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1665  hypothetical protein  30.69 
 
 
313 aa  84  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0645935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1278  ISSpo3, transposase  32.07 
 
 
292 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1219  transposase, putative  29.59 
 
 
307 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0871932 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3478  ISSpo8, transposase  30.22 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2705  ISTde3, transposase  29.9 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0973  transposase, putative  30 
 
 
286 aa  68.2  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.894035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0714  transposase, putative  28.87 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2368  transposase, putative  28 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0459  transcriptional regulator, LuxR family  25.64 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3320  putative ISH4 transposase  27.14 
 
 
294 aa  58.5  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.498779  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0871  putative ISH4 transposase  27.14 
 
 
294 aa  58.5  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1476  putative ISH4 transposase  27.14 
 
 
294 aa  58.5  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1705  putative ISH4 transposase  27.14 
 
 
294 aa  58.5  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.99413  normal  0.0773274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  24.27 
 
 
313 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0081  ISSpo8, transposase  25.26 
 
 
323 aa  55.1  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462993  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3708  ISSpo8, transposase  26.59 
 
 
329 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0147  transposase  28.87 
 
 
328 aa  52  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216525  normal  0.924195 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1099  hypothetical protein  22.79 
 
 
228 aa  51.6  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0206  putative transposase  27.87 
 
 
329 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0693887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1254  putative ISH4 transposase  30.52 
 
 
275 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2092  Insertion element protein  26.32 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223101  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0725  putative transposase  25.27 
 
 
318 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0048  putative transposase  26.85 
 
 
320 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000122957 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4200  Insertion element protein  25.66 
 
 
294 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.913227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1567  transposase, putative  27.27 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  24.73 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4134  putative transposase  24.39 
 
 
334 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436549  normal  0.202806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0407  transposase, putative  26.72 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01914  ISXoo10 transposase  24 
 
 
320 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.474572  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  24.67 
 
 
334 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  24.67 
 
 
334 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  22.56 
 
 
359 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  22.56 
 
 
366 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03202  ISXo2 putative transposase  25.68 
 
 
350 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  22.56 
 
 
356 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  22.56 
 
 
334 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  22.56 
 
 
334 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1956  hypothetical protein  25.66 
 
 
255 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  24.67 
 
 
333 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04014  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  42  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>