17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2705 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2705  ISTde3, transposase  100 
 
 
212 aa  427  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0459  transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2140  Transposase-like protein  30.48 
 
 
279 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1332  Transposase-like protein  30.48 
 
 
279 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.138478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1232  Transposase-like protein  30.48 
 
 
279 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1116  transposase  29.9 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.651522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0324  IS1016C2 transposase  31.28 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00443664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0642  insertion element IS1016 transposase  31.28 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1679  transposase  31.28 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1709  transposase  31.28 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0973  transposase, putative  23.04 
 
 
286 aa  58.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.894035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2368  transposase, putative  24.4 
 
 
290 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1375  putative insertion element IS1016 transposase  21.76 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1567  transposase, putative  25.25 
 
 
293 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1219  transposase, putative  25.35 
 
 
307 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0871932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0714  transposase, putative  23.81 
 
 
307 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0736  hypothetical protein  34.62 
 
 
288 aa  42  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000521528  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>