10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1375 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1375  putative insertion element IS1016 transposase  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0324  IS1016C2 transposase  29.52 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00443664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0642  insertion element IS1016 transposase  29.52 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1679  transposase  29.52 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1709  transposase  29.52 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1116  transposase  29.05 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.651522  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2705  ISTde3, transposase  21.13 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0459  transcriptional regulator, LuxR family  24.09 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1099  hypothetical protein  21.74 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1219  transposase, putative  26.9 
 
 		 307 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0871932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>