15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0459 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0459  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 229 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2705  ISTde3, transposase  28.04 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1232  Transposase-like protein  26.92 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1332  Transposase-like protein  26.92 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.138478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2140  Transposase-like protein  26.92 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165163  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1116  transposase  25.64 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.651522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1567  transposase, putative  25.55 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0324  IS1016C2 transposase  25.64 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00443664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0642  insertion element IS1016 transposase  25.64 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1679  transposase  25.64 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1709  transposase  25.64 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0973  transposase, putative  20.7 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.894035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0714  transposase, putative  23.81 
 
 		 307 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1375  putative insertion element IS1016 transposase  24.09 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1219  transposase, putative  21.4 
 
 		 307 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0871932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>