183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0043 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0043  IS1, transposase orfA  100 
 
 		 90 aa  189  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0449  Insertion element protein  90 
 
 		 90 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0667  Insertion element protein  90 
 
 		 90 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0943  Insertion element protein  84.27 
 
 		 108 aa  160  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4079  insertion element protein  77.78 
 
 		 90 aa  150  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0795  insertion element protein  77.91 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.531159  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0724  IS1, transposase orfA  77.91 
 
 		 87 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0178  IS1, transposase orfA  75.58 
 
 		 87 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00316211  hitchhiker  0.000000137018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0808  insertion element protein  55.56 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0735  IS1 family transposase orfA  55.56 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0740  IS1 family transposase orfA  55.56 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3685  Insertion element protein  75.41 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05988  hypothetical protein  48.35 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06001  hypothetical protein  48.35 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0106  IS1 transposase orfA  79.63 
 
 		 54 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.488726  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00023  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00210  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00236  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00314  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00341  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00505  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.429468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00546  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139116  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00572  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0146292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00588  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01116  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01243  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01372  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01880  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01935  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02041  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02144  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02271  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02451  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02513  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02647  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02824  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000223419  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03228  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03485  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04164  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04181  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04208  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01123  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04288  IS1 protein InsA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00510  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.490778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03180  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04180  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02773  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000500973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02232  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01384  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03436  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02477  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02415  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01999  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.967964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3119  IS1 transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.435416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02103  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00561  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0168725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00239  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00215  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00024  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00302867  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00345  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00577  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00318  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01922  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02608  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04172  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04126  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01870  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04143  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01981  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01252  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0367  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.353795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0738  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000115331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0781  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1141  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00733334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1164  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1385  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1529  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1652  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000502685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1780  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1899  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2197  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.101655  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2417  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0743259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2649  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0301022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2654  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000881357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2760  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000206512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2786  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2921  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3006  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3092  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3144  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3239  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0478113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3687  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4685  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3315  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.72613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4912  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00535  hypothetical protein  45.56 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0216  insertion element protein  45.05 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0064  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.408312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0329  IS1, transposase orfA  45.56 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04123  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.760134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>