140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0735 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0735  IS1 family transposase orfA  100 
 
 
91 aa  193  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0740  IS1 family transposase orfA  100 
 
 
91 aa  193  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0808  insertion element protein  100 
 
 
91 aa  193  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1013  putative dehydrogenase  76.47 
 
 
226 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0912501  normal  0.777049 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05988  hypothetical protein  51.69 
 
 
91 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06001  hypothetical protein  51.69 
 
 
91 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0449  Insertion element protein  55.56 
 
 
90 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0667  Insertion element protein  55.56 
 
 
90 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0043  IS1, transposase orfA  55.56 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00023  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00210  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00236  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00314  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00341  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00505  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.429468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00546  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139116  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00572  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0146292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00588  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01116  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01243  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01372  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01880  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01935  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02041  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02144  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02271  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02451  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02513  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02647  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02824  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000223419  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03228  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03485  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04164  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04181  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04208  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00577  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04288  IS1 protein InsA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00318  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3119  IS1 transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.435416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00510  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.490778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00345  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00535  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00215  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00561  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0168725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00024  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00302867  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01123  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0367  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.353795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0738  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000115331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0781  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1141  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00733334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1164  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1385  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1529  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1652  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000502685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1780  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1899  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2417  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0743259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2649  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0301022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2654  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000881357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2760  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000206512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2786  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2921  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3006  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3092  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3144  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3239  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0478113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3687  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4685  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3315  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.72613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4912  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01252  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04172  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00239  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01999  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.967964  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02232  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02477  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02415  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02103  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03180  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02773  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000500973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02608  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03436  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01981  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04180  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01922  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04143  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04126  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01870  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01384  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2197  IS1, transposase orfA  44.44 
 
 
91 aa  94  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.101655  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04160  IS1 protein InsA  43.33 
 
 
91 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2177  IS1, transposase orfA  43.33 
 
 
91 aa  94  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4871  IS1, transposase orfA  43.33 
 
 
91 aa  94  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4940  IS1, transposase orfA  43.33 
 
 
91 aa  94  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04123  hypothetical protein  43.33 
 
 
91 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.760134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0943  Insertion element protein  52.22 
 
 
108 aa  94  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3449  IS1 transposase orfA  42.22 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0724  IS1, transposase orfA  52.87 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0064  IS1, transposase orfA  43.33 
 
 
91 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.408312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0329  IS1, transposase orfA  43.33 
 
 
91 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>