21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1055 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1055  outer membrane protein  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  38.46 
 
 		 415 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  29.84 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  29.26 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  28.07 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  24.49 
 
 		 427 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  29.61 
 
 		 434 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  28.51 
 
 		 359 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 		 432 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  25.65 
 
 		 345 aa  50.1  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  29.06 
 
 		 466 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  26.63 
 
 		 457 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  27.4 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  26.22 
 
 		 381 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  28.04 
 
 		 362 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  29.27 
 
 		 375 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  25.53 
 
 		 365 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  26.8 
 
 		 447 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  23.5 
 
 		 388 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  29.27 
 
 		 375 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>