287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0636 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0636  exsB protein  100 
 
 		 241 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170308  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0734  ExsB  91.3 
 
 		 235 aa  417  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0736  ExsB  83.61 
 
 		 243 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1063  exsB protein  74.12 
 
 		 237 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1260  exsB protein  70.39 
 
 		 252 aa  345  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0152  exsB protein  67.98 
 
 		 244 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0355  exsB protein  67.98 
 
 		 244 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.311751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0171  exsB protein  67.98 
 
 		 244 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2363  exsB protein  67.98 
 
 		 244 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2284  exsB protein  67.98 
 
 		 244 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2795  exsB protein  67.98 
 
 		 244 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0161  ExsB protein  67.98 
 
 		 244 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.720442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0139  exsB protein  70.09 
 
 		 235 aa  338  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0137  exsB protein  66.67 
 
 		 244 aa  337  7e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.948426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0043  exsB protein  66.67 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3116  exsB protein  66.67 
 
 		 244 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0417269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1874  exsB protein  65.96 
 
 		 249 aa  335  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2697  exsB protein  69.33 
 
 		 238 aa  335  5e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0317  exsB protein  65.79 
 
 		 244 aa  332  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0258  exsB protein  65.27 
 
 		 241 aa  332  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3174  exsB protein  65.79 
 
 		 244 aa  331  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3057  exsB protein  65.79 
 
 		 244 aa  331  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3135  exsB protein  64.91 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6470  ExsB family protein  64.91 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4407  ExsB  67.12 
 
 		 232 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2505  ExsB  64.91 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0508398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3119  exsB protein  64.91 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284413  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4006  exsB protein  65.8 
 
 		 235 aa  328  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6745  exsB protein  67.11 
 
 		 233 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1967  exsB protein  65.11 
 
 		 239 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4986  exsB protein  66.96 
 
 		 237 aa  323  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6597  exsB protein  66.23 
 
 		 233 aa  321  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0272  exsB protein  62.5 
 
 		 236 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0441813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0270  hypothetical protein  64.91 
 
 		 235 aa  316  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.786819  normal  0.0153678 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1846  ExsB  63.98 
 
 		 238 aa  315  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2751  ExsB  64.07 
 
 		 240 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625985  normal  0.635682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1816  exsB protein  62.5 
 
 		 247 aa  311  7.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.957931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3148  exsB protein  65.04 
 
 		 236 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185944  normal  0.138551 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2751  ExsB  62.13 
 
 		 238 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0719409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1081  exsB protein  62.18 
 
 		 250 aa  308  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1163  exsB protein  67.26 
 
 		 239 aa  307  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.609927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1226  exsB protein  63.33 
 
 		 243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2709  ExsB  62.55 
 
 		 238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.492214  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3150  exsB protein  61.84 
 
 		 237 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1453  ExsB  61.64 
 
 		 238 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4081  hypothetical protein  63.11 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0717  exsB protein  61.18 
 
 		 243 aa  301  6.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal  0.832317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1387  exsB protein  65.49 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2643  ExsB  62.22 
 
 		 236 aa  297  8e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2234  exsB protein  63.39 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2744  exsB protein  63.39 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0596  exsB protein  59.11 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.906918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1083  exsB protein  58.33 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.324758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3394  exsB protein  60.34 
 
 		 245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.872777  normal  0.201125 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1125  exsB protein  56.89 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1826  ExsB protein  51.97 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412081  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003399  queuosine Biosynthesis QueC ATPase  48.9 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2349  exsB protein  51.09 
 
 		 227 aa  225  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00952166  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02384  queuosine biosynthesis protein QueC  49.34 
 
 		 232 aa  224  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4541  queuosine biosynthesis protein QueC  49.78 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2255  queuosine biosynthesis protein QueC  49.78 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.489699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2269  queuosine biosynthesis protein QueC  49.78 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00296977  normal  0.263758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1854  queuosine biosynthesis protein QueC  49.35 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.330643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0480  queuosine biosynthesis protein QueC  51.75 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0487  queuosine biosynthesis protein QueC  51.75 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0521  queuosine biosynthesis protein QueC  51.75 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0104585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2115  queuosine biosynthesis protein QueC  49.78 
 
 		 240 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0367  queuosine biosynthesis protein QueC  51.75 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.976295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3165  exsB protein  51.75 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.6328  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0373  exsB protein  48.9 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0980  queuosine biosynthesis protein QueC  50.22 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1876  exsB protein  49.36 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.96525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00396  predicted aluminum resistance protein  51.32 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2161  queuosine biosynthesis protein QueC  49.78 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0464548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0530  queuosine biosynthesis protein QueC  51.32 
 
 		 231 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3188  queuosine biosynthesis protein QueC  51.32 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0204492 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00400  hypothetical protein  51.32 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2552  exsB protein  48.29 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312258  hitchhiker  0.0077162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2062  exsB protein  49.34 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0514  queuosine biosynthesis protein QueC  51.32 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0504  queuosine biosynthesis protein QueC  50.88 
 
 		 231 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2015  queuosine biosynthesis protein QueC  49.34 
 
 		 232 aa  218  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0869  PP-loop superfamily ATPase  48.89 
 
 		 217 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000338884  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0495  queuosine biosynthesis protein QueC  50.88 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0558  queuosine biosynthesis protein QueC  50.88 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0497  queuosine biosynthesis protein QueC  50.88 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1965  queuosine biosynthesis protein QueC  46.72 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.681821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3227  queuosine biosynthesis protein QueC  51.09 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3046  queuosine biosynthesis protein QueC  51.09 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3085  queuosine biosynthesis protein QueC  51.09 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000336836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0911  queuosine biosynthesis protein QueC  50 
 
 		 242 aa  214  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3257  queuosine biosynthesis protein QueC  48.71 
 
 		 231 aa  214  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0736  exsB protein  47.81 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.52345  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0752  exsB protein  47.81 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1055  queuosine biosynthesis protein QueC  49.12 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.717702  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2048  ExsB protein  48.92 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.49129  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1102  queuosine biosynthesis protein QueC  49.34 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232921  hitchhiker  0.00000230205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3062  exsB protein  48.7 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2059  queuosine biosynthesis protein QueC  48.42 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2870  exsB protein  46.55 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>