286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2709 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2709  ExsB  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.492214  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2751  ExsB  92.8 
 
 		 238 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0719409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3150  exsB protein  85.41 
 
 		 237 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2751  ExsB  81.62 
 
 		 240 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625985  normal  0.635682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4081  hypothetical protein  84.14 
 
 		 241 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1846  ExsB  78.81 
 
 		 238 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1453  ExsB  76.69 
 
 		 238 aa  381  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6745  exsB protein  72.49 
 
 		 233 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6597  exsB protein  72.37 
 
 		 233 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1874  exsB protein  69.1 
 
 		 249 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1967  exsB protein  70.94 
 
 		 239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0272  exsB protein  64.68 
 
 		 236 aa  322  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0441813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3116  exsB protein  66.07 
 
 		 244 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0417269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3057  exsB protein  66.52 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3174  exsB protein  66.52 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2795  exsB protein  65.62 
 
 		 244 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0152  exsB protein  65.62 
 
 		 244 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2363  exsB protein  65.62 
 
 		 244 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0355  exsB protein  65.62 
 
 		 244 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.311751  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6470  ExsB family protein  65.62 
 
 		 244 aa  318  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0161  ExsB protein  65.62 
 
 		 244 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.720442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0171  exsB protein  65.62 
 
 		 244 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2284  exsB protein  65.62 
 
 		 244 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2505  ExsB  65.62 
 
 		 244 aa  317  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0508398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3119  exsB protein  65.62 
 
 		 244 aa  317  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3135  exsB protein  65.62 
 
 		 244 aa  317  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0043  exsB protein  63.52 
 
 		 243 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0137  exsB protein  65.18 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.948426  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0258  exsB protein  65.82 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1226  exsB protein  74.11 
 
 		 243 aa  315  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3394  exsB protein  69.91 
 
 		 245 aa  315  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.872777  normal  0.201125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1816  exsB protein  63.68 
 
 		 247 aa  313  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.957931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3148  exsB protein  68.75 
 
 		 236 aa  313  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185944  normal  0.138551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0317  exsB protein  62.66 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4407  ExsB  65.32 
 
 		 232 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2697  exsB protein  64.19 
 
 		 238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1163  exsB protein  73.99 
 
 		 239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.609927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1387  exsB protein  73.54 
 
 		 243 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2234  exsB protein  65.5 
 
 		 239 aa  310  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2744  exsB protein  65.5 
 
 		 239 aa  310  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0736  ExsB  64.81 
 
 		 243 aa  308  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1260  exsB protein  63 
 
 		 252 aa  307  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1063  exsB protein  63.16 
 
 		 237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4006  exsB protein  66.22 
 
 		 235 aa  306  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1125  exsB protein  62.72 
 
 		 239 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2643  ExsB  63.95 
 
 		 236 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0139  exsB protein  65.45 
 
 		 235 aa  299  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4986  exsB protein  62.56 
 
 		 237 aa  297  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1083  exsB protein  60.68 
 
 		 258 aa  294  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.324758  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0717  exsB protein  63.39 
 
 		 243 aa  294  8e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal  0.832317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0734  ExsB  65.78 
 
 		 235 aa  291  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0636  exsB protein  62.55 
 
 		 241 aa  286  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170308  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0270  hypothetical protein  61.61 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.786819  normal  0.0153678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1081  exsB protein  60.71 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0596  exsB protein  57.39 
 
 		 242 aa  274  9e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.906918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0752  exsB protein  46.44 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0736  exsB protein  46.44 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.52345  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0373  exsB protein  48.09 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0869  PP-loop superfamily ATPase  48.28 
 
 		 217 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000338884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3949  exsB protein  48.48 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.431114  normal  0.0627168 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1497  exsB protein  48.48 
 
 		 220 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00251456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1458  exsB protein  48.48 
 
 		 220 aa  211  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.275784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1230  aluminum resistance protein  48.48 
 
 		 220 aa  211  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1232  aluminum resistance protein  48.48 
 
 		 220 aa  211  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1257  exsB protein  48.05 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1359  ExsB family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1394  exsB protein  48.05 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.83856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1430  exsB protein  48.05 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191771 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1826  ExsB protein  48.25 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412081  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0894  exsB protein  48.05 
 
 		 221 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1064  exsB protein  47.62 
 
 		 220 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.704642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1256  exsB protein  47.62 
 
 		 220 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1877  exsB protein  47.62 
 
 		 222 aa  208  7e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1770  exsB protein  48.05 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0319  exsB protein  49.15 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3165  exsB protein  46.98 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.6328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0367  queuosine biosynthesis protein QueC  46.98 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.976295  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0521  queuosine biosynthesis protein QueC  46.98 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0104585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0480  queuosine biosynthesis protein QueC  46.98 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0487  queuosine biosynthesis protein QueC  46.98 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2062  exsB protein  46.93 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0530  queuosine biosynthesis protein QueC  46.55 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2349  exsB protein  46.7 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00952166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00396  predicted aluminum resistance protein  46.55 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00400  hypothetical protein  46.55 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3188  queuosine biosynthesis protein QueC  46.55 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0204492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0558  queuosine biosynthesis protein QueC  46.55 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2870  exsB protein  46.12 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0504  queuosine biosynthesis protein QueC  46.55 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224809 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4541  queuosine biosynthesis protein QueC  44.07 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0497  queuosine biosynthesis protein QueC  46.55 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2255  queuosine biosynthesis protein QueC  44.07 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.489699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2269  queuosine biosynthesis protein QueC  44.07 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00296977  normal  0.263758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0495  queuosine biosynthesis protein QueC  46.55 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2552  exsB protein  45.8 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312258  hitchhiker  0.0077162 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0980  queuosine biosynthesis protein QueC  44.16 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0514  queuosine biosynthesis protein QueC  46.12 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1055  queuosine biosynthesis protein QueC  46.12 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.717702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1854  queuosine biosynthesis protein QueC  44.93 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.330643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2115  queuosine biosynthesis protein QueC  44.59 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>