287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1063 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1063  exsB protein  100 
 
 		 237 aa  486  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1260  exsB protein  75.64 
 
 		 252 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0734  ExsB  74.79 
 
 		 235 aa  362  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0736  ExsB  71.01 
 
 		 243 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0636  exsB protein  74.12 
 
 		 241 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170308  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0258  exsB protein  64.83 
 
 		 241 aa  325  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0272  exsB protein  64.63 
 
 		 236 aa  325  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0441813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0139  exsB protein  66.08 
 
 		 235 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3057  exsB protein  64.73 
 
 		 244 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0043  exsB protein  63.6 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4006  exsB protein  68.33 
 
 		 235 aa  320  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2505  ExsB  64.29 
 
 		 244 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0508398  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3174  exsB protein  64.73 
 
 		 244 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361858  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3119  exsB protein  64.29 
 
 		 244 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3135  exsB protein  64.29 
 
 		 244 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3116  exsB protein  64.29 
 
 		 244 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0417269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0317  exsB protein  63.44 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6470  ExsB family protein  63.84 
 
 		 244 aa  317  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1874  exsB protein  67.41 
 
 		 249 aa  317  9e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1967  exsB protein  64.5 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0152  exsB protein  62.5 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0171  exsB protein  62.5 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0355  exsB protein  62.5 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.311751  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2363  exsB protein  62.5 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2284  exsB protein  62.5 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2795  exsB protein  62.5 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0161  ExsB protein  62.5 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.720442  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1846  ExsB  63.36 
 
 		 238 aa  315  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0137  exsB protein  62.5 
 
 		 244 aa  315  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.948426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6597  exsB protein  64.78 
 
 		 233 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4407  ExsB  64.41 
 
 		 232 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6745  exsB protein  65.22 
 
 		 233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3150  exsB protein  63.44 
 
 		 237 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2751  ExsB  62.72 
 
 		 238 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0719409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4986  exsB protein  61.47 
 
 		 237 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2744  exsB protein  66.96 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2234  exsB protein  66.96 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1453  ExsB  62.07 
 
 		 238 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2709  ExsB  63.16 
 
 		 238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.492214  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2697  exsB protein  63.11 
 
 		 238 aa  304  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4081  hypothetical protein  62.22 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2751  ExsB  62.11 
 
 		 240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625985  normal  0.635682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0717  exsB protein  62.17 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal  0.832317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1816  exsB protein  61.78 
 
 		 247 aa  298  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.957931  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0270  hypothetical protein  62.39 
 
 		 235 aa  298  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.786819  normal  0.0153678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1163  exsB protein  67.26 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.609927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2643  ExsB  62.39 
 
 		 236 aa  295  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1081  exsB protein  62.67 
 
 		 250 aa  294  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1226  exsB protein  65.49 
 
 		 243 aa  294  7e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3394  exsB protein  62.77 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.872777  normal  0.201125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3148  exsB protein  59.83 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185944  normal  0.138551 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1387  exsB protein  65.47 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0596  exsB protein  58.15 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.906918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1125  exsB protein  57.78 
 
 		 239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1083  exsB protein  53.45 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.324758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2349  exsB protein  50.66 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00952166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1826  ExsB protein  49.57 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412081  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4541  queuosine biosynthesis protein QueC  49.14 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2255  queuosine biosynthesis protein QueC  49.14 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.489699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2269  queuosine biosynthesis protein QueC  49.14 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00296977  normal  0.263758 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003399  queuosine Biosynthesis QueC ATPase  50 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1965  queuosine biosynthesis protein QueC  49.35 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.681821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2161  queuosine biosynthesis protein QueC  49.14 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0464548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2552  exsB protein  48.31 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312258  hitchhiker  0.0077162 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2115  queuosine biosynthesis protein QueC  48.71 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02384  queuosine biosynthesis protein QueC  48.26 
 
 		 232 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0487  queuosine biosynthesis protein QueC  49.79 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1854  queuosine biosynthesis protein QueC  48.91 
 
 		 245 aa  222  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.330643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3165  exsB protein  49.79 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.6328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0367  queuosine biosynthesis protein QueC  49.79 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.976295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0480  queuosine biosynthesis protein QueC  49.79 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0521  queuosine biosynthesis protein QueC  49.79 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0104585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2015  queuosine biosynthesis protein QueC  46.61 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1876  exsB protein  49.78 
 
 		 235 aa  221  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.96525  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0514  queuosine biosynthesis protein QueC  50.65 
 
 		 231 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0980  queuosine biosynthesis protein QueC  50.22 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0530  queuosine biosynthesis protein QueC  49.36 
 
 		 231 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  0.679412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00396  predicted aluminum resistance protein  49.36 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0558  queuosine biosynthesis protein QueC  50.22 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3188  queuosine biosynthesis protein QueC  49.36 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0204492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2048  ExsB protein  48.73 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.49129  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0497  queuosine biosynthesis protein QueC  50.22 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00400  hypothetical protein  49.36 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0495  queuosine biosynthesis protein QueC  50.22 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0504  queuosine biosynthesis protein QueC  51.93 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224809 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0373  exsB protein  48.89 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0911  queuosine biosynthesis protein QueC  48.93 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0736  exsB protein  47.39 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.52345  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0752  exsB protein  47.39 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3062  exsB protein  47.86 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2062  exsB protein  47.16 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2059  queuosine biosynthesis protein QueC  48.87 
 
 		 239 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1916  queuosine biosynthesis protein QueC  48.42 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247307  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2503  queuosine biosynthesis protein QueC  48.42 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0869  PP-loop superfamily ATPase  47.64 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000338884  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1877  exsB protein  44.35 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1102  queuosine biosynthesis protein QueC  47.58 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232921  hitchhiker  0.00000230205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2870  exsB protein  47.21 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2164  queuosine biosynthesis protein QueC  48.42 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1055  queuosine biosynthesis protein QueC  48.26 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.717702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>