291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2059 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2059  queuosine biosynthesis protein QueC  100 
 
 		 239 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1916  queuosine biosynthesis protein QueC  98.74 
 
 		 239 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2164  queuosine biosynthesis protein QueC  98.32 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1854  queuosine biosynthesis protein QueC  91.74 
 
 		 245 aa  454  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.330643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2503  queuosine biosynthesis protein QueC  94.2 
 
 		 238 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2115  queuosine biosynthesis protein QueC  91.34 
 
 		 240 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2161  queuosine biosynthesis protein QueC  90.48 
 
 		 240 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0464548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2269  queuosine biosynthesis protein QueC  90.04 
 
 		 240 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00296977  normal  0.263758 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4541  queuosine biosynthesis protein QueC  90.04 
 
 		 240 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2255  queuosine biosynthesis protein QueC  90.04 
 
 		 240 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.489699  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2015  queuosine biosynthesis protein QueC  81.06 
 
 		 232 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1876  exsB protein  82.06 
 
 		 235 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.96525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1826  ExsB protein  80.62 
 
 		 230 aa  394  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412081  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2349  exsB protein  81.17 
 
 		 227 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00952166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2062  exsB protein  78.57 
 
 		 227 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2552  exsB protein  75.43 
 
 		 233 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312258  hitchhiker  0.0077162 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2048  ExsB protein  76.89 
 
 		 232 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.49129  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02384  queuosine biosynthesis protein QueC  77.58 
 
 		 232 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003399  queuosine Biosynthesis QueC ATPase  76.68 
 
 		 231 aa  377  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1965  queuosine biosynthesis protein QueC  76.34 
 
 		 227 aa  374  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.681821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0980  queuosine biosynthesis protein QueC  75.34 
 
 		 231 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3257  queuosine biosynthesis protein QueC  70.04 
 
 		 231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1055  queuosine biosynthesis protein QueC  68.58 
 
 		 231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.717702  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2870  exsB protein  66.67 
 
 		 231 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3227  queuosine biosynthesis protein QueC  67.84 
 
 		 232 aa  334  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3085  queuosine biosynthesis protein QueC  67.84 
 
 		 232 aa  334  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000336836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3046  queuosine biosynthesis protein QueC  67.84 
 
 		 232 aa  334  7.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1102  queuosine biosynthesis protein QueC  69 
 
 		 232 aa  334  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232921  hitchhiker  0.00000230205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3062  exsB protein  65.79 
 
 		 231 aa  329  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0487  queuosine biosynthesis protein QueC  66.67 
 
 		 231 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0521  queuosine biosynthesis protein QueC  66.67 
 
 		 231 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0104585  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0495  queuosine biosynthesis protein QueC  67.11 
 
 		 231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0558  queuosine biosynthesis protein QueC  67.11 
 
 		 231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0367  queuosine biosynthesis protein QueC  66.67 
 
 		 231 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.976295  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0497  queuosine biosynthesis protein QueC  67.11 
 
 		 231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0480  queuosine biosynthesis protein QueC  66.67 
 
 		 231 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193162  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0504  queuosine biosynthesis protein QueC  67.11 
 
 		 231 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224809 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3165  exsB protein  66.23 
 
 		 231 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.6328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0530  queuosine biosynthesis protein QueC  66.23 
 
 		 231 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  0.679412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00396  predicted aluminum resistance protein  66.23 
 
 		 231 aa  325  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0514  queuosine biosynthesis protein QueC  66.67 
 
 		 231 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3188  queuosine biosynthesis protein QueC  66.23 
 
 		 231 aa  325  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0204492 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00400  hypothetical protein  66.23 
 
 		 231 aa  325  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0911  queuosine biosynthesis protein QueC  66.67 
 
 		 242 aa  324  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0262  exsB protein  61.11 
 
 		 238 aa  291  7e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0373  exsB protein  61.11 
 
 		 223 aa  281  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0736  exsB protein  58.82 
 
 		 222 aa  278  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.52345  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0752  exsB protein  58.82 
 
 		 222 aa  278  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0894  exsB protein  61.21 
 
 		 221 aa  275  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1064  exsB protein  60.28 
 
 		 220 aa  270  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.704642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1770  exsB protein  58.04 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1394  exsB protein  59.35 
 
 		 220 aa  267  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.83856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1458  exsB protein  58.88 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.275784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1230  aluminum resistance protein  58.88 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1232  aluminum resistance protein  58.88 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1497  exsB protein  58.88 
 
 		 220 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00251456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1256  exsB protein  58.41 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3949  exsB protein  58.88 
 
 		 220 aa  265  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.431114  normal  0.0627168 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1257  exsB protein  58.88 
 
 		 220 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1359  ExsB family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 220 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1430  exsB protein  58.88 
 
 		 220 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191771 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0869  PP-loop superfamily ATPase  55.61 
 
 		 217 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000338884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1063  exsB protein  48.47 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1260  exsB protein  47.21 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0137  exsB protein  48.1 
 
 		 244 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.948426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2795  exsB protein  48.71 
 
 		 244 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0171  exsB protein  48.71 
 
 		 244 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0152  exsB protein  48.71 
 
 		 244 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0355  exsB protein  48.71 
 
 		 244 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.311751  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2363  exsB protein  48.71 
 
 		 244 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2284  exsB protein  48.71 
 
 		 244 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0161  ExsB protein  48.71 
 
 		 244 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.720442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3116  exsB protein  48.1 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0417269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3135  exsB protein  46.84 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2505  ExsB  46.84 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0508398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3119  exsB protein  46.84 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284413  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6470  ExsB family protein  45.99 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3057  exsB protein  46.41 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3174  exsB protein  46.41 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361858  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0736  ExsB  46.84 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0317  exsB protein  46.96 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1846  ExsB  46.84 
 
 		 238 aa  209  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0043  exsB protein  44.64 
 
 		 243 aa  207  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4407  ExsB  45.85 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2697  exsB protein  46.81 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0258  exsB protein  48.03 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1874  exsB protein  47.14 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0272  exsB protein  47.58 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0441813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0636  exsB protein  48.48 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170308  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0734  ExsB  48.47 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0139  exsB protein  45.81 
 
 		 235 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4081  hypothetical protein  44.4 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1081  exsB protein  44.9 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2709  ExsB  45.02 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.492214  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1125  exsB protein  46.15 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3148  exsB protein  44.77 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185944  normal  0.138551 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1453  ExsB  45.69 
 
 		 238 aa  198  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0596  exsB protein  45.3 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.906918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6745  exsB protein  44.49 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2751  ExsB  44.21 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0719409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>