287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3148 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3148  exsB protein  100 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185944  normal  0.138551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0043  exsB protein  67.1 
 
 		 243 aa  321  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4081  hypothetical protein  65.4 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3057  exsB protein  66.24 
 
 		 244 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3174  exsB protein  66.24 
 
 		 244 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6745  exsB protein  67.95 
 
 		 233 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1846  ExsB  67.7 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2751  ExsB  66.95 
 
 		 238 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0719409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3116  exsB protein  65.38 
 
 		 244 aa  314  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0417269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0152  exsB protein  64.98 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2284  exsB protein  64.98 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0355  exsB protein  64.98 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.311751  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6470  ExsB family protein  64.96 
 
 		 244 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2363  exsB protein  64.98 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3135  exsB protein  64.96 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2709  ExsB  68.75 
 
 		 238 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.492214  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0171  exsB protein  64.98 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2505  ExsB  64.96 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0508398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0161  ExsB protein  64.98 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.720442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3119  exsB protein  64.96 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2795  exsB protein  64.98 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0137  exsB protein  64.56 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.948426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1874  exsB protein  65.79 
 
 		 249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0317  exsB protein  64.5 
 
 		 244 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3150  exsB protein  64.81 
 
 		 237 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0258  exsB protein  64.1 
 
 		 241 aa  309  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4407  ExsB  65.49 
 
 		 232 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0272  exsB protein  64.29 
 
 		 236 aa  307  9e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0441813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0736  ExsB  62.61 
 
 		 243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1453  ExsB  65.49 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2751  ExsB  65.35 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625985  normal  0.635682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1260  exsB protein  61.3 
 
 		 252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1967  exsB protein  65.93 
 
 		 239 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1226  exsB protein  67.24 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0139  exsB protein  63.88 
 
 		 235 aa  299  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2697  exsB protein  64.47 
 
 		 238 aa  299  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.70556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0734  ExsB  65.94 
 
 		 235 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0717  exsB protein  63.84 
 
 		 243 aa  297  7e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal  0.832317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0270  hypothetical protein  63.88 
 
 		 235 aa  297  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.786819  normal  0.0153678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6597  exsB protein  65.04 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1387  exsB protein  67.11 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1081  exsB protein  59.91 
 
 		 250 aa  294  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0636  exsB protein  65.04 
 
 		 241 aa  292  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170308  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1063  exsB protein  59.83 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4986  exsB protein  61.67 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4006  exsB protein  60.61 
 
 		 235 aa  288  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2234  exsB protein  60.17 
 
 		 239 aa  287  9e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2744  exsB protein  60.17 
 
 		 239 aa  287  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1163  exsB protein  65.79 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.609927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2643  ExsB  61.61 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3394  exsB protein  62.5 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.872777  normal  0.201125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1816  exsB protein  57.87 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.957931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1125  exsB protein  56.33 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0596  exsB protein  55.22 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.906918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1083  exsB protein  54.59 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.324758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2349  exsB protein  47.41 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00952166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1826  ExsB protein  46.55 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412081  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2062  exsB protein  47.21 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1854  queuosine biosynthesis protein QueC  45.8 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.330643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2552  exsB protein  46.12 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312258  hitchhiker  0.0077162 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2015  queuosine biosynthesis protein QueC  45.26 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2115  queuosine biosynthesis protein QueC  46.12 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2161  queuosine biosynthesis protein QueC  46.12 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0464548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2269  queuosine biosynthesis protein QueC  45.69 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00296977  normal  0.263758 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4541  queuosine biosynthesis protein QueC  45.69 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2255  queuosine biosynthesis protein QueC  45.69 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.489699  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02384  queuosine biosynthesis protein QueC  45.02 
 
 		 232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1877  exsB protein  42.24 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1876  exsB protein  45.45 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.96525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2048  ExsB protein  45.02 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.49129  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003399  queuosine Biosynthesis QueC ATPase  45.89 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0373  exsB protein  43.97 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0894  exsB protein  45.49 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0736  exsB protein  44.1 
 
 		 222 aa  192  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.52345  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0752  exsB protein  44.1 
 
 		 222 aa  192  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0980  queuosine biosynthesis protein QueC  43.29 
 
 		 231 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0319  exsB protein  49.55 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3949  exsB protein  45.65 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.431114  normal  0.0627168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1256  exsB protein  45.22 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0504  queuosine biosynthesis protein QueC  45.49 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224809 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0869  PP-loop superfamily ATPase  45.02 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000338884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1064  exsB protein  45.22 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.704642  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0558  queuosine biosynthesis protein QueC  45.53 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0495  queuosine biosynthesis protein QueC  45.53 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0497  queuosine biosynthesis protein QueC  45.53 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1458  exsB protein  45.22 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.275784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1230  aluminum resistance protein  45.22 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1232  aluminum resistance protein  45.22 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1497  exsB protein  45.22 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00251456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1770  exsB protein  46.22 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0480  queuosine biosynthesis protein QueC  45.3 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0487  queuosine biosynthesis protein QueC  45.3 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0521  queuosine biosynthesis protein QueC  45.3 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0104585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0367  queuosine biosynthesis protein QueC  45.3 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.976295  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3165  exsB protein  45.3 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.6328  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2164  queuosine biosynthesis protein QueC  45.78 
 
 		 239 aa  188  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1916  queuosine biosynthesis protein QueC  45.33 
 
 		 239 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1359  ExsB family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1430  exsB protein  44.78 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191771 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0514  queuosine biosynthesis protein QueC  45.11 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>