19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2511 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2511  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6557  hypothetical protein  56.18 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0139497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4210  hypothetical protein  56.14 
 
 		 233 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3613  hypothetical protein  56.74 
 
 		 197 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.265269  hitchhiker  0.000230131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3197  hypothetical protein  55.28 
 
 		 202 aa  202  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.414361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4427  hypothetical protein  51.16 
 
 		 243 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.328932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3079  hypothetical protein  50.57 
 
 		 227 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0026  hypothetical protein  44.9 
 
 		 235 aa  195  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00586095  normal  0.766607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3436  hypothetical protein  43.81 
 
 		 215 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.160224  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  32.99 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  34.04 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  35.42 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0306  peptidase M20  29.9 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  32.67 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63350  GNAT family acetyltransferase  32.04 
 
 		 160 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0386363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 161 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  28.87 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5516  hypothetical protein  37.66 
 
 		 160 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  31.82 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>