12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3613 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3613  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.265269  hitchhiker  0.000230131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6557  hypothetical protein  61.24 
 
 		 274 aa  241  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0139497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2511  hypothetical protein  56.74 
 
 		 330 aa  216  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4210  hypothetical protein  54.49 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0026  hypothetical protein  50.8 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00586095  normal  0.766607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4427  hypothetical protein  54.02 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.328932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3197  hypothetical protein  58.44 
 
 		 202 aa  196  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.414361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3079  hypothetical protein  52.1 
 
 		 227 aa  192  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3436  hypothetical protein  51.16 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.160224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63350  GNAT family acetyltransferase  28.18 
 
 		 160 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0386363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5516  hypothetical protein  30.23 
 
 		 160 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 		 161 aa  41.2  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>