52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1220 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1220  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3055  hypothetical protein  93.4 
 
 		 212 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2947  hypothetical protein  69.86 
 
 		 211 aa  287  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2731  hypothetical protein  69.86 
 
 		 211 aa  287  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2812  hypothetical protein  69.86 
 
 		 211 aa  287  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.292874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2835  hypothetical protein  69.86 
 
 		 211 aa  287  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290746  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2772  hypothetical protein  69.86 
 
 		 211 aa  287  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3045  hypothetical protein  68.42 
 
 		 211 aa  285  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0241771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2713  hypothetical protein  69.57 
 
 		 211 aa  278  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3659  hypothetical protein  72.94 
 
 		 218 aa  278  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1108  HAD superfamily (subfamily IF) hydrolase, YfhB  69.57 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1117  hypothetical protein  69.57 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2925  hypothetical protein  69.57 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2845  hypothetical protein  69.57 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2713  hypothetical protein  69.57 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3795  hypothetical protein  69.57 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02418  hypothetical protein  69.57 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3620  hypothetical protein  75.24 
 
 		 231 aa  277  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1250  hypothetical protein  75.24 
 
 		 231 aa  277  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1144  hypothetical protein  75.24 
 
 		 215 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02454  hypothetical protein  67.89 
 
 		 190 aa  245  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2774  hypothetical protein  62.32 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4675  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194004  normal  0.0151968 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0161  hypothetical protein  25.58 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04005  hypothetical protein  24.44 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2806  hypothetical protein  29.26 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0114125  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  25 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3717  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.65 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0339005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  22.83 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5237  hypothetical protein  28.12 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  24.76 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4446  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.44 
 
 		 290 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  22.69 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0542  Phosphoserine phosphatase-like protein  26.19 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6219  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  28.28 
 
 		 289 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.75 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0665  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25 
 
 		 295 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  24.26 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.9 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  22.22 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.93 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2722  HAD family hydrolase  25.23 
 
 		 305 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0916  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23.92 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1167  HAD family hydrolase  25.23 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  22.73 
 
 		 268 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  26.02 
 
 		 200 aa  42  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0069  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 295 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0248353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1328  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.55 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.55 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>