26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02454 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1108  HAD superfamily (subfamily IF) hydrolase, YfhB  100 
 
 		 211 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02418  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3795  hypothetical protein  99.47 
 
 		 211 aa  386  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2925  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  388  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1117  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  388  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2845  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  388  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02454  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2713  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  388  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2713  hypothetical protein  98.95 
 
 		 211 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2947  hypothetical protein  91.58 
 
 		 211 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2772  hypothetical protein  91.58 
 
 		 211 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2835  hypothetical protein  91.58 
 
 		 211 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290746  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2812  hypothetical protein  91.58 
 
 		 211 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.292874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2731  hypothetical protein  91.58 
 
 		 211 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3045  hypothetical protein  86.32 
 
 		 211 aa  328  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0241771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3055  hypothetical protein  68.95 
 
 		 212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1220  hypothetical protein  67.89 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3659  hypothetical protein  67.37 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1250  hypothetical protein  65.26 
 
 		 231 aa  224  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3620  hypothetical protein  65.26 
 
 		 231 aa  224  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1144  hypothetical protein  65.26 
 
 		 215 aa  224  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2774  hypothetical protein  56.17 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5237  hypothetical protein  33.8 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2806  hypothetical protein  31.33 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0114125  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0161  hypothetical protein  27.37 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0542  Phosphoserine phosphatase-like protein  28.57 
 
 		 289 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>