39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1144 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1250  hypothetical protein  99.53 
 
 		 231 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3620  hypothetical protein  99.53 
 
 		 231 aa  435  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1144  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3659  hypothetical protein  76.78 
 
 		 218 aa  294  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3055  hypothetical protein  75.73 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1220  hypothetical protein  75.24 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3045  hypothetical protein  66.02 
 
 		 211 aa  271  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0241771 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2812  hypothetical protein  69.42 
 
 		 211 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.292874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2835  hypothetical protein  69.42 
 
 		 211 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290746  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2772  hypothetical protein  69.42 
 
 		 211 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2731  hypothetical protein  69.42 
 
 		 211 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2947  hypothetical protein  69.42 
 
 		 211 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2925  hypothetical protein  66.5 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2713  hypothetical protein  66.5 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1117  hypothetical protein  66.5 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02418  hypothetical protein  66.5 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1108  HAD superfamily (subfamily IF) hydrolase, YfhB  66.5 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2845  hypothetical protein  66.5 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2713  hypothetical protein  66.5 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3795  hypothetical protein  66.5 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02454  hypothetical protein  65.26 
 
 		 190 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2774  hypothetical protein  59.91 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4675  hypothetical protein  31.4 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194004  normal  0.0151968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5237  hypothetical protein  29.79 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0161  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  26 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04005  hypothetical protein  26.53 
 
 		 238 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  21.23 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  24.62 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  25.89 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2806  hypothetical protein  28.21 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0114125  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  27.19 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3717  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.84 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0339005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.57 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 357 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1271  HAD family hydrolase  23.53 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>