201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4588 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4588  Hsp20 family heat-shock protein  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.791882 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3145  heat shock protein Hsp20  75 
 
 		 182 aa  140  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  60 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2939  heat shock protein Hsp20  57.89 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4626  heat shock protein Hsp20  62.03 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5555  heat shock protein Hsp20  56.63 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1531  heat shock protein Hsp20  54.17 
 
 		 156 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.217499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  52.5 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  51.19 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  55.42 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  56.1 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  55 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  57.69 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1754  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.19811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  53.16 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  57.69 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5227  heat shock protein Hsp20  50.63 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0487576  normal  0.385827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  51.09 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6473  heat shock protein Hsp20  50.53 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4311  heat shock protein Hsp20  50.63 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4551  heat shock protein Hsp20  50.63 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.448918  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  51.11 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  51.81 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  55.13 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  48.1 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  42.71 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1214  heat shock protein Hsp20  48.84 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  48.39 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2073  heat shock protein Hsp20  49.37 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1322  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  47.31 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  50 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3510  heat shock protein Hsp20  44.79 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.420499  normal  0.371318 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5641  heat shock protein Hsp20  50.65 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0051  16 kDa heat shock protein A  51.22 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  45.35 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2505  heat shock protein Hsp20  52.56 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2830  heat shock protein Hsp20  48.39 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0456781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  44.83 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  45.45 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  41.3 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  53.16 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  43.33 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  50.63 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  48.15 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2501  heat shock protein Hsp20  47.56 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  51.22 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  48.15 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  48.15 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  44.83 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  44.83 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  49.35 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  49.35 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  49.35 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  48.78 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  48.78 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  48.78 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  48.78 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  50.65 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  46.74 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  50.65 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  52.5 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  44.94 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  52.56 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  47.13 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  45.56 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  50 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  49.37 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0384  heat shock protein Hsp20  43.37 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  41.76 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  49.38 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0763  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 158 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  50.63 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  47.5 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2726  heat shock protein Hsp20  46.84 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239135  normal  0.135003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2715  heat shock protein Hsp20  48.89 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  49.37 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  45.57 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2202  heat shock protein Hsp20  55.56 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23680  heat-shock protein IbpA  48.1 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2006  heat-shock protein IbpA  48.1 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2141  global stress protein GspA  43.82 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3816  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  41.76 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0614  Hsp20/alpha crystallin family protein  45.24 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  46.75 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  45.68 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.272184 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  48.05 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  48.05 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  48.05 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>