18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3064 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3064  hypothetical protein  100 
 
 		 660 aa  1343    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  37.42 
 
 		 1164 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  40.99 
 
 		 677 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  35.71 
 
 		 1741 aa  62.4  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  33.54 
 
 		 1458 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  32.32 
 
 		 1459 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.29 
 
 		 1322 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  30.34 
 
 		 1172 aa  50.8  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  32.58 
 
 		 2407 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  30.72 
 
 		 3954 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  31.48 
 
 		 1111 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.21 
 
 		 2363 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.14 
 
 		 1694 aa  47  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  29.63 
 
 		 1130 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.53 
 
 		 1227 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  30.91 
 
 		 4238 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  30.91 
 
 		 3822 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  31.68 
 
 		 4238 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>