142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2645 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2645  chemotaxis protein MotA  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.121356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2749  flagellar motor protein MotA  60.96 
 
 		 289 aa  203  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1316  flagellar motor protein MotA  63.01 
 
 		 289 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.210771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2976  flagellar motor protein MotA  63.01 
 
 		 289 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.749081 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2951  flagellar motor protein MotA  64.71 
 
 		 289 aa  200  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777037  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4184  flagellar motor protein MotA  54.79 
 
 		 288 aa  178  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3260  flagellar motor protein MotA  57.36 
 
 		 289 aa  168  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2918  flagellar motor protein MotA  44.97 
 
 		 287 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1900  flagellar motor protein MotA  43.06 
 
 		 286 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.139415  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0867  flagellar motor protein MotA  49.66 
 
 		 289 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1260  flagellar motor protein MotA  41.61 
 
 		 287 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894303  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2519  flagellar motor protein MotA  47.66 
 
 		 290 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03068  flagellar motor protein MotA  44.54 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38 
 
 		 286 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3454  flagellar motor protein MotA  40 
 
 		 293 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.345342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  37.84 
 
 		 286 aa  107  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  40.43 
 
 		 286 aa  106  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0439  flagellar motor protein MotA  39.85 
 
 		 284 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.03 
 
 		 286 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 286 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3481  chemotaxis protein  37.24 
 
 		 301 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0252598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  36 
 
 		 285 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 286 aa  100  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  42.11 
 
 		 286 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  39.31 
 
 		 283 aa  99.4  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4421  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.46 
 
 		 286 aa  99.4  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  40.6 
 
 		 286 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  39.13 
 
 		 283 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  42.11 
 
 		 286 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  42.11 
 
 		 286 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  41.35 
 
 		 286 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  41.35 
 
 		 286 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  42.11 
 
 		 286 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  41.35 
 
 		 286 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  41.35 
 
 		 286 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  42.11 
 
 		 286 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  41.35 
 
 		 286 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  41.35 
 
 		 286 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  41.35 
 
 		 286 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  41.35 
 
 		 286 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  41.35 
 
 		 286 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  41.35 
 
 		 286 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  40.6 
 
 		 286 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  41.35 
 
 		 286 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  36.09 
 
 		 295 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.76 
 
 		 312 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04950  flagellar motor protein MotA  37.14 
 
 		 285 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.1 
 
 		 287 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0642  flagellar motor protein MotA  38.62 
 
 		 281 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.509529  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  38.26 
 
 		 283 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.895123 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  35.34 
 
 		 295 aa  93.6  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  37.59 
 
 		 295 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  37.59 
 
 		 295 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  37.59 
 
 		 295 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  37.59 
 
 		 295 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  37.59 
 
 		 295 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  37.59 
 
 		 295 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  35.86 
 
 		 286 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  35.34 
 
 		 295 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5683  flagellar motor protein MotA  37.58 
 
 		 283 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  33.1 
 
 		 301 aa  91.7  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  36.09 
 
 		 295 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  35.17 
 
 		 286 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  36.09 
 
 		 295 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  35.17 
 
 		 286 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2872  chemotaxis signal transduction protein CheY  35.17 
 
 		 286 aa  91.3  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  36.09 
 
 		 295 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  36.84 
 
 		 295 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  36.84 
 
 		 295 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 		 270 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  35.86 
 
 		 283 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  36.84 
 
 		 295 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  36.84 
 
 		 295 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  36.84 
 
 		 295 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  36.84 
 
 		 295 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  36.84 
 
 		 295 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  34.51 
 
 		 295 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  36.09 
 
 		 295 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2804  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 		 296 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.920347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24320  Fagellar motor protein  35.66 
 
 		 291 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  30.34 
 
 		 285 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  36.05 
 
 		 283 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2583  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.82 
 
 		 287 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.756929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  33.83 
 
 		 286 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1842  motA, chemotaxis (motility protein A  38.64 
 
 		 285 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1085  flagellar motor protein MotA  37.93 
 
 		 281 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  36.05 
 
 		 283 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4217  flagellar motor protein MotA  36.15 
 
 		 290 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299726  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5982  flagellar motor component-like protein  34.46 
 
 		 289 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.583801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  36.05 
 
 		 283 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0313  flagellar motor protein MotA  34.62 
 
 		 290 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3351  flagellar motor protein MotA  35.57 
 
 		 287 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4697  flagellar motor protein MotA  36.05 
 
 		 283 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0283  flagellar motor protein MotA  34.9 
 
 		 287 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0606654  normal  0.545308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  36.24 
 
 		 283 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  36.55 
 
 		 285 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  34.56 
 
 		 289 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0018  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.61 
 
 		 323 aa  83.6  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.76 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0345  flagellar motor protein MotA  32.31 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0285898 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>