215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2630 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2630  flagellar motor protein  100 
 
 
166 aa  343  7e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2749  flagellar motor protein MotA  65.16 
 
 
289 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1316  flagellar motor protein MotA  67.12 
 
 
289 aa  207  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.210771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2976  flagellar motor protein MotA  67.12 
 
 
289 aa  207  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.749081 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3260  flagellar motor protein MotA  61.94 
 
 
289 aa  202  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4184  flagellar motor protein MotA  63.23 
 
 
288 aa  201  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2951  flagellar motor protein MotA  62.58 
 
 
289 aa  201  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777037  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0867  flagellar motor protein MotA  56.29 
 
 
289 aa  165  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2519  flagellar motor protein MotA  53.38 
 
 
290 aa  155  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1900  flagellar motor protein MotA  50 
 
 
286 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.139415  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3454  flagellar motor protein MotA  48.75 
 
 
293 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.345342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2918  flagellar motor protein MotA  49.65 
 
 
287 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1260  flagellar motor protein MotA  48.92 
 
 
287 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894303  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1842  motA, chemotaxis (motility protein A  43.24 
 
 
285 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  40.13 
 
 
295 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  40.76 
 
 
301 aa  125  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5982  flagellar motor component-like protein  44.76 
 
 
289 aa  124  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.583801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.28 
 
 
312 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.12 
 
 
289 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0250  flagellar motor protein MotA  39.62 
 
 
292 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0249106  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4217  flagellar motor protein MotA  38.22 
 
 
290 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299726  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0018  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.58 
 
 
323 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0126  flagellar motor protein MotA  37.82 
 
 
290 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3481  chemotaxis protein  37.34 
 
 
301 aa  120  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0252598  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5606  chemotaxis MotA protein  41.61 
 
 
287 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  44.06 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0117  flagellar motor protein MotA  37.58 
 
 
339 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0642  flagellar motor protein MotA  42.45 
 
 
281 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.509529  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 
287 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2804  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.22 
 
 
296 aa  118  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.920347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1711  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.34 
 
 
295 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.620792  normal  0.172807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3227  flagellar motor protein MotA  43.15 
 
 
284 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03068  flagellar motor protein MotA  45.9 
 
 
284 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3687  chemotaxis protein MotA  40.41 
 
 
299 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366746  normal  0.0257375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0728  flagellar motor protein MotA  36.48 
 
 
291 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0643  chemotaxis MotA protein  36.14 
 
 
291 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.385067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0345  flagellar motor protein MotA  35.85 
 
 
290 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0285898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0313  flagellar motor protein MotA  36.48 
 
 
290 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0654  chemotaxis MotA protein  36.14 
 
 
291 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4158  chemotaxis MotA protein  38.04 
 
 
286 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1085  flagellar motor protein MotA  37.14 
 
 
281 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  41.33 
 
 
286 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0622  chemotaxis MotA protein  36.75 
 
 
291 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  39.73 
 
 
286 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  39.04 
 
 
286 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  36.97 
 
 
286 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  36.97 
 
 
286 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  36.97 
 
 
286 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2266  flagellar motor protein MotA  40.41 
 
 
301 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  40.41 
 
 
301 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2179  flagellar motor protein MotA  37.14 
 
 
282 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3212  chemotaxis MotA protein  35.44 
 
 
290 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  37.93 
 
 
285 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2872  chemotaxis signal transduction protein CheY  42.36 
 
 
286 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2641  flagellar motor component  38.62 
 
 
284 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.300205  hitchhiker  0.0000105245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  36.99 
 
 
295 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1088  flagellar motor protein MotA  36.31 
 
 
281 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  36.99 
 
 
295 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.5 
 
 
286 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  36.48 
 
 
283 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 
286 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.02 
 
 
270 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  36.99 
 
 
295 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  36.99 
 
 
295 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 
286 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2583  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.58 
 
 
287 aa  104  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.756929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24320  Fagellar motor protein  40.79 
 
 
291 aa  104  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0439  flagellar motor protein MotA  41.41 
 
 
284 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  35.62 
 
 
298 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  37.67 
 
 
286 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1035  flagellar motor protein MotA  35.19 
 
 
283 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  36.99 
 
 
286 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  47.75 
 
 
285 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  35.66 
 
 
283 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  34.36 
 
 
286 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  35.62 
 
 
295 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  35.62 
 
 
295 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  35.62 
 
 
295 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  38.3 
 
 
293 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  40.56 
 
 
283 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  40.56 
 
 
283 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  36.42 
 
 
283 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  36.42 
 
 
283 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.895123 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1435  chemotaxis protein  35.62 
 
 
273 aa  99.8  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4697  flagellar motor protein MotA  37.04 
 
 
283 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>