More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1570 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1570  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0191  hypothetical protein  57.14 
 
 
241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.562836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0413  hypothetical protein  57.56 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  0.0301388 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1307  hypothetical protein  57.81 
 
 
218 aa  216  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.989244  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0914  chromosome partitioning ATPase  43.7 
 
 
246 aa  191  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.800283  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0179  GTP/ATP binding protein, putative  34.43 
 
 
340 aa  93.2  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  40 
 
 
372 aa  92.4  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  34.5 
 
 
367 aa  92  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  31.65 
 
 
376 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  34.23 
 
 
360 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  29.64 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  35.11 
 
 
382 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  32.38 
 
 
304 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  34.38 
 
 
395 aa  87  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  35.48 
 
 
363 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 
270 aa  86.7  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  36.08 
 
 
368 aa  86.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.8 
 
 
298 aa  85.5  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  37.57 
 
 
367 aa  85.5  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  33.15 
 
 
357 aa  85.1  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  31.72 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1654  nucleotide-binding protein  30.42 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0329038  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  31.86 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  34.95 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  34.04 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  32.42 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  31.38 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  32.8 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0678  ATPase-like, ParA/MinD  35.59 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  30.85 
 
 
363 aa  82  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0159  hypothetical protein  29.95 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  31.65 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1918  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  34.57 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  31.82 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  31.82 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  33.18 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  30.59 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01920  conserved hypothetical protein  33.99 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00584688  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37610  predicted protein  31 
 
 
462 aa  80.1  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00176951  normal  0.0190501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0660  nucleotide-binding protein  30.96 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522627  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1273  MRP family ATP-binding protein  28.93 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0109668  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.58 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  30 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  31.96 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0147  mrp protein  37.84 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0140  ATP-binding protein; Mrp protein  37.84 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0179  mrp protein  37.84 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000468885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  34.04 
 
 
371 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  35.6 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  29.64 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  32.62 
 
 
363 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  32.45 
 
 
371 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0147  mrp protein  37.84 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0142  ATP-binding protein; Mrp protein  37.84 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0160  mrp protein  37.84 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.751e-23 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  31.44 
 
 
365 aa  79  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  32.45 
 
 
371 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0147  mrp protein  37.84 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862151  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  30.32 
 
 
370 aa  79  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  27.35 
 
 
286 aa  79  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  32.45 
 
 
371 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2286  chromosome partitioning ATPase  30.7 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 
362 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  32.45 
 
 
371 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  34.04 
 
 
371 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  31.91 
 
 
358 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  32.95 
 
 
291 aa  78.6  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2935  hypothetical protein  34.33 
 
 
377 aa  78.6  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  34.81 
 
 
368 aa  78.6  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1574  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  34.57 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69151  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  30.11 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  31.19 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1656  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  32.98 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0291919  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1731  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  32.98 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159284  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  32.45 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  32.98 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  32.98 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0141  ATP-binding protein; Mrp protein  36.76 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000822787  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1341  protein of unknown function DUF59  28.86 
 
 
445 aa  77  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5157  mrp protein  37.3 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000807541  hitchhiker  0.0000208567 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  32.5 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0142  hypothetical protein  37.3 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1985  nucleotide-binding protein  29.09 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  32.37 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  30.32 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0169  mrp protein  37.3 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0723648  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  31.71 
 
 
278 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  30.88 
 
 
354 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.55 
 
 
362 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1702  chromosome partitioning ATPase  33.7 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0377  hypothetical protein  32.83 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1706  ATPase-like, ParA/MinD  32.39 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0562575  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  32.09 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  32.76 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  30.48 
 
 
362 aa  77  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  33.33 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>