More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0377 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0377  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  681    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  38.46 
 
 
361 aa  237  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  38.62 
 
 
360 aa  235  7e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  39.54 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  45.04 
 
 
358 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  45.04 
 
 
358 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  44.35 
 
 
357 aa  232  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  40.91 
 
 
336 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  36.81 
 
 
347 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  41.5 
 
 
374 aa  229  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  38.89 
 
 
359 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  42.64 
 
 
361 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  48.39 
 
 
368 aa  228  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  48.58 
 
 
382 aa  228  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  37.79 
 
 
356 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  37.76 
 
 
364 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  37.57 
 
 
364 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  37.39 
 
 
363 aa  226  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  39.49 
 
 
369 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2227  hypothetical protein  42.66 
 
 
355 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221852  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  37.23 
 
 
351 aa  226  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  38.7 
 
 
365 aa  225  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  38.28 
 
 
353 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  45.2 
 
 
376 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.25 
 
 
367 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  45.36 
 
 
364 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  37.8 
 
 
362 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  34.47 
 
 
357 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  39.54 
 
 
364 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  37.5 
 
 
373 aa  223  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  38.87 
 
 
365 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  37.36 
 
 
353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  37.24 
 
 
370 aa  222  6e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  45.17 
 
 
362 aa  222  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  44.8 
 
 
373 aa  222  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.8 
 
 
376 aa  221  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  45.82 
 
 
370 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  37.36 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  44.8 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.89 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  44.36 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  46.96 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  47.46 
 
 
378 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  35.4 
 
 
354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  34.65 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  39.38 
 
 
369 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  39.38 
 
 
369 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  39.38 
 
 
369 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  39.38 
 
 
369 aa  220  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  39.38 
 
 
369 aa  220  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  39.38 
 
 
369 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  39.38 
 
 
369 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  39.38 
 
 
369 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  39.38 
 
 
369 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  46.15 
 
 
382 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  44.44 
 
 
363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2343  putative ATPase  39.49 
 
 
369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.717701  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2388  putative ATPase  39.49 
 
 
369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627982  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2500  putative ATPase  39.49 
 
 
369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  45.93 
 
 
373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2299  putative ATPase  39.49 
 
 
369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1547  ParA family protein  43.85 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97129  hitchhiker  0.000107443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  34.67 
 
 
368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  45.38 
 
 
388 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1645  hypothetical protein  40.12 
 
 
364 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  39.88 
 
 
361 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  39.88 
 
 
361 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  39.88 
 
 
361 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  44.22 
 
 
285 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  44.53 
 
 
363 aa  218  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  46.61 
 
 
364 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  46.64 
 
 
375 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  36.46 
 
 
395 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  45.56 
 
 
415 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  42.34 
 
 
362 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  42.34 
 
 
362 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  42.34 
 
 
362 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  42.34 
 
 
362 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  42.34 
 
 
362 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  39.68 
 
 
362 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  39.68 
 
 
362 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  44.72 
 
 
372 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1406  hypothetical protein  38.29 
 
 
362 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.295791  normal  0.937662 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  42.34 
 
 
362 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  43.68 
 
 
363 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  43.61 
 
 
362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.13 
 
 
362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  48.26 
 
 
364 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  45.75 
 
 
371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16185  predicted protein  43.67 
 
 
289 aa  216  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  43.89 
 
 
362 aa  216  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  41.44 
 
 
354 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  42.38 
 
 
363 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  49.56 
 
 
360 aa  216  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  37.65 
 
 
371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2197  ATPase-like, ParA/MinD  40.12 
 
 
368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  44.31 
 
 
394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  41.5 
 
 
363 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  38.58 
 
 
364 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  38.58 
 
 
364 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>