143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0200 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0200  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1267  adenine phosphoribosyltransferase  73.91 
 
 
230 aa  346  1e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1854  adenine phosphoribosyltransferase  71.74 
 
 
230 aa  345  3e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.787643 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2104  adenine phosphoribosyltransferase  71.74 
 
 
230 aa  334  5e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.52752  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0563  adenine phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
242 aa  177  9e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0138344 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1212  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.279163  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0023  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
235 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00393898 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1785  adenine phosphoribosyltransferase  36.29 
 
 
248 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0254  adenine phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 
237 aa  99  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2790  phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1102  phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 
250 aa  88.2  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0958  phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.934235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  25.12 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  38.84 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  34.96 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
191 aa  62  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  36.75 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  27.78 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0772  phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.15147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
190 aa  58.9  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0364  xanthine phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
193 aa  58.9  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  29.1 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  35.61 
 
 
798 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  25 
 
 
270 aa  56.2  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 
190 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  29.03 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
190 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2400  pur operon repressor  29.76 
 
 
272 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
194 aa  55.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  32.81 
 
 
197 aa  55.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  38.52 
 
 
200 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
190 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0067  xanthine phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00414676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  23.79 
 
 
274 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0175  pur operon repressor  34.4 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0230472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  33.62 
 
 
282 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  33.62 
 
 
282 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0435  xanthine phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 
192 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.584524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0446  xanthine phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 
192 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  33.62 
 
 
282 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  33.62 
 
 
282 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
189 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  33.62 
 
 
282 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  33.62 
 
 
282 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  33.62 
 
 
282 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  33.62 
 
 
282 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  33.62 
 
 
282 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  33.62 
 
 
282 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
189 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  27.38 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  27.38 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1608  pur operon repressor  28.69 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  33.62 
 
 
282 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2147  xanthine phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  27.93 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 
180 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  26.89 
 
 
191 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0902677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2004  phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
181 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2501  pur operon repressor  25 
 
 
267 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  24.41 
 
 
171 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
193 aa  48.5  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
170 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 
175 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  26.27 
 
 
171 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 
170 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
183 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  28.15 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
177 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  25.2 
 
 
178 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
171 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
190 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1380  hypothetical protein  30.7 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.282947  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  27.73 
 
 
271 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 
179 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  28 
 
 
189 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2815  pur operon repressor  23.39 
 
 
267 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 
192 aa  45.8  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
181 aa  45.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  29.46 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  32.41 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  26.52 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  25.76 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>