182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1484 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1541  urocanate hydratase  77.27 
 
 
619 aa  1018    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.284209  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3679  urocanate hydratase  57.01 
 
 
552 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3404  urocanate hydratase  57.19 
 
 
552 aa  637    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3353  urocanate hydratase  57.01 
 
 
552 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3661  urocanate hydratase  57.01 
 
 
552 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3684  urocanate hydratase  57.19 
 
 
552 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414953  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1522  urocanate hydratase  57.09 
 
 
549 aa  640    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.492365  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1484  urocanate hydratase  100 
 
 
616 aa  1260    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1893  urocanate hydratase  57.3 
 
 
550 aa  657    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2311  urocanate hydratase  57.74 
 
 
552 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.599874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3441  urocanate hydratase  56.83 
 
 
552 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3711  urocanate hydratase  56.83 
 
 
552 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0342728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3759  urocanate hydratase  56.83 
 
 
552 aa  633  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3338  urocanate hydratase  56.65 
 
 
552 aa  633  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1557  urocanate hydratase  56.47 
 
 
552 aa  631  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0743786  normal  0.0292483 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1461  urocanate hydratase  59.1 
 
 
549 aa  628  1e-178  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.801738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2159  urocanate hydratase  56.81 
 
 
551 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2356  urocanate hydratase  53.97 
 
 
553 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1282  urocanate hydratase  56.47 
 
 
552 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0391092  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2399  urocanate hydratase  53.97 
 
 
553 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2819  urocanate hydratase  56.2 
 
 
549 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1048  urocanate hydratase  54.68 
 
 
557 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.155699  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0583  urocanate hydratase  55.25 
 
 
554 aa  581  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0629  urocanate hydratase  53.54 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3618  urocanate hydratase  53.55 
 
 
551 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0116497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0253  urocanate hydratase  51.64 
 
 
556 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2007  urocanate hydratase  52.52 
 
 
554 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339801  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2376  urocanate hydratase  51.23 
 
 
570 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0100  urocanate hydratase  50.55 
 
 
551 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.431481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1593  urocanate hydratase  54.48 
 
 
554 aa  561  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4043  urocanate hydratase  53.06 
 
 
585 aa  560  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2735  urocanate hydratase  51.88 
 
 
565 aa  549  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3000  urocanate hydratase  49.82 
 
 
558 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136861  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4397  urocanate hydratase  51.69 
 
 
555 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3641  urocanate hydratase  53.28 
 
 
551 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278935  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1110  urocanate hydratase  50.82 
 
 
549 aa  551  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26180  urocanate hydratase  50.46 
 
 
559 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.60353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5833  urocanate hydratase  49.13 
 
 
559 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1334  urocanate hydratase  49.18 
 
 
554 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1330  urocanate hydratase  48.99 
 
 
554 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1021  urocanate hydratase  49.45 
 
 
566 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67350  urocanate hydratase  48.6 
 
 
559 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4452  urocanate hydratase  51.65 
 
 
554 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0891581  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0805  urocanate hydratase  49.91 
 
 
593 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392094  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4138  urocanate hydratase  49.72 
 
 
568 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0360  urocanate hydratase  48.64 
 
 
560 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5083  urocanate hydratase  50.28 
 
 
557 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34014  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1635  urocanate hydratase  52.54 
 
 
547 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.787055 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0076  urocanate hydratase  49.72 
 
 
563 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1263  urocanate hydratase  48.83 
 
 
561 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776789  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4086  urocanate hydratase  49.72 
 
 
563 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5033  urocanate hydratase  50.28 
 
 
557 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0826  urocanate hydratase  49.91 
 
 
561 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5270  urocanate hydratase  48.91 
 
 
607 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0896  urocanate hydratase  48.92 
 
 
557 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5636  urocanate hydratase  49.18 
 
 
559 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5048  urocanate hydratase  47.55 
 
 
559 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0940  urocanate hydratase  49.91 
 
 
561 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00715979  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1660  urocanate hydratase  52.19 
 
 
550 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0917  urocanate hydratase  49.91 
 
 
561 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0937043  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4070  urocanate hydratase  50.28 
 
 
553 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4907  urocanate hydratase  50.28 
 
 
557 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99976  normal  0.401042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3902  urocanate hydratase  48.62 
 
 
563 aa  537  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.736698  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2333  urocanate hydratase  52.46 
 
 
550 aa  537  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345602  normal  0.755078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0431  urocanate hydratase  50.09 
 
 
557 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145771  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2641  urocanate hydratase  48.73 
 
 
561 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.990677  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4828  urocanate hydratase  48.72 
 
 
565 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1773  Urocanate hydratase  51.18 
 
 
551 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0949014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2881  urocanate hydratase  49.19 
 
 
572 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3834  urocanate hydratase  51.29 
 
 
595 aa  533  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6265  urocanate hydratase  52.94 
 
 
548 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1414  urocanate hydratase  49.82 
 
 
552 aa  532  1e-150  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.359346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3646  urocanate hydratase  49.01 
 
 
573 aa  532  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.455234  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0854  urocanate hydratase  49.72 
 
 
561 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4107  urocanate hydratase  50.71 
 
 
598 aa  534  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4552  urocanate hydratase  48.9 
 
 
558 aa  534  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2475  urocanate hydratase  49.01 
 
 
572 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.638897  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0885  urocanate hydratase  49.72 
 
 
561 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0909  urocanate hydratase  49.64 
 
 
564 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2715  urocanate hydratase  48.01 
 
 
566 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1930  urocanate hydratase  48.57 
 
 
572 aa  529  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03127  urocanate hydratase  49.64 
 
 
563 aa  529  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2647  urocanate hydratase  47.43 
 
 
601 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.147461  normal  0.780355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1679  urocanate hydratase  52.93 
 
 
560 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.582007  normal  0.204575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2359  urocanate hydratase  51.47 
 
 
546 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.629943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1042  urocanate hydratase  47.93 
 
 
579 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0991609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2854  urocanate hydratase  47.83 
 
 
568 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289939  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6925  urocanate hydratase  49.28 
 
 
557 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102745  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0374  urocanate hydratase  50.54 
 
 
564 aa  525  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1000  urocanate hydratase  50.82 
 
 
549 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0040  urocanate hydratase  50 
 
 
551 aa  528  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2315  urocanate hydratase  53.1 
 
 
546 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641522  normal  0.0309572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1812  urocanate hydratase  48.46 
 
 
562 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596639  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2552  urocanate hydratase  49.09 
 
 
555 aa  525  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2086  urocanate hydratase  48.64 
 
 
562 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951228  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1265  urocanate hydratase  48.01 
 
 
563 aa  522  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1822  urocanate hydratase  48.46 
 
 
562 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1508  urocanate hydratase  52.35 
 
 
546 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1164  urocanate hydratase  48.06 
 
 
572 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5930  urocanate hydratase  48.73 
 
 
557 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.138114 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>