182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1000 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5033  urocanate hydratase  60.41 
 
 		 557 aa  661    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0629  urocanate hydratase  66.67 
 
 		 552 aa  718    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2086  urocanate hydratase  58.79 
 
 		 562 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3679  urocanate hydratase  63.99 
 
 		 552 aa  708    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0909  urocanate hydratase  60.04 
 
 		 564 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0932  urocanate hydratase  59.78 
 
 		 557 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0917  urocanate hydratase  59.85 
 
 		 561 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0937043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5270  urocanate hydratase  60.77 
 
 		 607 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3441  urocanate hydratase  63.8 
 
 		 552 aa  709    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3404  urocanate hydratase  63.99 
 
 		 552 aa  707    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3353  urocanate hydratase  63.99 
 
 		 552 aa  709    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0647  urocanate hydratase  60.07 
 
 		 562 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1334  urocanate hydratase  57.98 
 
 		 554 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1330  urocanate hydratase  57.98 
 
 		 554 aa  640    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4828  urocanate hydratase  60.77 
 
 		 565 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0896  urocanate hydratase  60.96 
 
 		 557 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2715  urocanate hydratase  59.12 
 
 		 566 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5636  urocanate hydratase  60.96 
 
 		 559 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1100  urocanate hydratase  58.79 
 
 		 562 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2794  urocanate hydratase  60.07 
 
 		 562 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0360  urocanate hydratase  59.12 
 
 		 560 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2936  urocanase  63.9 
 
 		 908 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26180  urocanate hydratase  60.59 
 
 		 559 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.60353  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4138  urocanate hydratase  60.81 
 
 		 568 aa  672    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3711  urocanate hydratase  63.8 
 
 		 552 aa  709    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0342728  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5956  urocanate hydratase  58.7 
 
 		 557 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1822  urocanate hydratase  59.71 
 
 		 562 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1508  urocanate hydratase  65.62 
 
 		 546 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1838  urocanate hydratase  79.6 
 
 		 557 aa  845    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227163  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1164  urocanate hydratase  60.79 
 
 		 572 aa  665    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0854  urocanate hydratase  59.67 
 
 		 561 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3684  urocanate hydratase  63.99 
 
 		 552 aa  707    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414953  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2187  urocanate hydratase  58.61 
 
 		 562 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2854  urocanate hydratase  60.04 
 
 		 568 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5048  urocanate hydratase  61.14 
 
 		 559 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1048  urocanate hydratase  62.13 
 
 		 557 aa  696    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.155699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2735  urocanate hydratase  63.1 
 
 		 565 aa  700    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2552  urocanate hydratase  60.37 
 
 		 555 aa  646    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2447  urocanate hydratase  65.56 
 
 		 546 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.557101  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5907  urocanate hydratase  58.61 
 
 		 562 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0583  urocanate hydratase  68.68 
 
 		 554 aa  734    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1021  urocanate hydratase  61.83 
 
 		 566 aa  672    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0102  urocanate hydratase  60.22 
 
 		 555 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3338  urocanate hydratase  63.25 
 
 		 552 aa  706    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03127  urocanate hydratase  60.33 
 
 		 563 aa  650    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0940  urocanate hydratase  59.85 
 
 		 561 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00715979  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2359  urocanate hydratase  65.75 
 
 		 546 aa  663    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.629943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3953  urocanate hydratase  60.07 
 
 		 556 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1601  urocanate hydratase  61.25 
 
 		 555 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.308587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2209  urocanate hydratase  58.97 
 
 		 562 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67350  urocanate hydratase  61.36 
 
 		 559 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0374  urocanate hydratase  71.38 
 
 		 564 aa  764    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2170  urocanate hydratase  58.61 
 
 		 562 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.337819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2376  urocanate hydratase  59.45 
 
 		 570 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0826  urocanate hydratase  59.85 
 
 		 561 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4838  urocanate hydratase  59.85 
 
 		 556 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5083  urocanate hydratase  60.41 
 
 		 557 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4397  urocanate hydratase  75.37 
 
 		 555 aa  815    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458241  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1000  urocanate hydratase  100 
 
 		 549 aa  1109    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2819  urocanate hydratase  62.52 
 
 		 549 aa  701    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1557  urocanate hydratase  63.62 
 
 		 552 aa  705    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0743786  normal  0.0292483 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2364  urocanate hydratase  60.07 
 
 		 562 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.738454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3759  urocanate hydratase  63.8 
 
 		 552 aa  706    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2921  urocanate hydratase  60.07 
 
 		 562 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1580  urocanate hydratase  63.44 
 
 		 560 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21091  normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0885  urocanate hydratase  59.67 
 
 		 561 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2665  urocanate hydratase  60.07 
 
 		 562 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2881  urocanate hydratase  58.7 
 
 		 572 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2721  urocanate hydratase  60.07 
 
 		 562 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1679  urocanate hydratase  60.07 
 
 		 562 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3661  urocanate hydratase  63.99 
 
 		 552 aa  709    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0076  urocanate hydratase  60.81 
 
 		 563 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1110  urocanate hydratase  96.34 
 
 		 549 aa  1071    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1263  urocanate hydratase  60.77 
 
 		 561 aa  667    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0079  urocanate hydratase  60.41 
 
 		 555 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4070  urocanate hydratase  60.41 
 
 		 553 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1295  urocanate hydratase  60.55 
 
 		 554 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0784383  normal  0.0497778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0588  urocanate hydratase  70.14 
 
 		 580 aa  759    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0156659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1749  urocanate hydratase  61.44 
 
 		 556 aa  638    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6450  urocanate hydratase  59.82 
 
 		 556 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2356  urocanate hydratase  60 
 
 		 553 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0874  urocanate hydratase  59.96 
 
 		 557 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4630  urocanate hydratase  60.52 
 
 		 555 aa  655    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4907  urocanate hydratase  60.41 
 
 		 557 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99976  normal  0.401042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0431  urocanate hydratase  60.04 
 
 		 557 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1893  urocanate hydratase  58.32 
 
 		 550 aa  674    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4656  urocanate hydratase  59.41 
 
 		 559 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312199  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2399  urocanate hydratase  60 
 
 		 553 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3902  urocanate hydratase  59.67 
 
 		 563 aa  670    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.736698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5833  urocanate hydratase  61.14 
 
 		 559 aa  666    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4452  urocanate hydratase  77.94 
 
 		 554 aa  828    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0891581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0097  urocanate hydratase  60.41 
 
 		 555 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1433  urocanate hydratase  59.41 
 
 		 557 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2311  urocanate hydratase  64.72 
 
 		 552 aa  715    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.599874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2315  urocanate hydratase  66.61 
 
 		 546 aa  677    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641522  normal  0.0309572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4086  urocanate hydratase  60.81 
 
 		 563 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1461  urocanate hydratase  61.43 
 
 		 549 aa  662    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.801738  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00729  urocanate hydratase  60.18 
 
 		 555 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.985849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4447  urocanate hydratase  59.85 
 
 		 556 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0805  urocanate hydratase  61.17 
 
 		 593 aa  680    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>