182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3834 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5033  urocanate hydratase  57.87 
 
 		 557 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0629  urocanate hydratase  61.66 
 
 		 552 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3679  urocanate hydratase  64.74 
 
 		 552 aa  723    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5270  urocanate hydratase  57.4 
 
 		 607 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3441  urocanate hydratase  64.56 
 
 		 552 aa  720    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3404  urocanate hydratase  64.74 
 
 		 552 aa  723    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3353  urocanate hydratase  64.17 
 
 		 552 aa  722    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4828  urocanate hydratase  57.58 
 
 		 565 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0896  urocanate hydratase  56.96 
 
 		 557 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2715  urocanate hydratase  56.89 
 
 		 566 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5636  urocanate hydratase  56.96 
 
 		 559 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3338  urocanate hydratase  64.06 
 
 		 552 aa  724    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0360  urocanate hydratase  56.37 
 
 		 560 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5083  urocanate hydratase  57.87 
 
 		 557 aa  656    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3711  urocanate hydratase  64.56 
 
 		 552 aa  720    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0342728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3618  urocanate hydratase  60.9 
 
 		 551 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0116497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0940  urocanate hydratase  55.58 
 
 		 561 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00715979  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1042  urocanate hydratase  56.61 
 
 		 579 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0991609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0826  urocanate hydratase  55.58 
 
 		 561 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4043  urocanate hydratase  86.28 
 
 		 585 aa  1033    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2854  urocanate hydratase  56.89 
 
 		 568 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5048  urocanate hydratase  57.4 
 
 		 559 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1048  urocanate hydratase  59.67 
 
 		 557 aa  672    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.155699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3000  urocanate hydratase  59.43 
 
 		 558 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136861  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0583  urocanate hydratase  62.03 
 
 		 554 aa  658    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2159  urocanate hydratase  62.55 
 
 		 551 aa  690    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4552  urocanate hydratase  57.32 
 
 		 558 aa  643    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1593  urocanate hydratase  60.94 
 
 		 554 aa  663    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67350  urocanate hydratase  58.42 
 
 		 559 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0917  urocanate hydratase  55.58 
 
 		 561 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0937043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2376  urocanate hydratase  60.75 
 
 		 570 aa  673    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3641  urocanate hydratase  58.38 
 
 		 551 aa  653    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0431  urocanate hydratase  57.14 
 
 		 557 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0253  urocanate hydratase  58.59 
 
 		 556 aa  652    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1265  urocanate hydratase  57.63 
 
 		 563 aa  636    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4107  urocanate hydratase  75.71 
 
 		 598 aa  924    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3834  urocanate hydratase  100 
 
 		 595 aa  1222    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4138  urocanate hydratase  56.94 
 
 		 568 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0100  urocanate hydratase  58.77 
 
 		 551 aa  653    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.431481 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1522  urocanate hydratase  57.32 
 
 		 549 aa  651    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.492365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1282  urocanate hydratase  61.66 
 
 		 552 aa  696    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0391092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0076  urocanate hydratase  56.94 
 
 		 563 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1263  urocanate hydratase  56.83 
 
 		 561 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4070  urocanate hydratase  56.78 
 
 		 553 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3759  urocanate hydratase  64.59 
 
 		 552 aa  726    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2641  urocanate hydratase  57.99 
 
 		 561 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.990677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1557  urocanate hydratase  64.23 
 
 		 552 aa  726    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0743786  normal  0.0292483 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2356  urocanate hydratase  62.88 
 
 		 553 aa  719    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2819  urocanate hydratase  62.21 
 
 		 549 aa  683    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4630  urocanate hydratase  57.64 
 
 		 555 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4907  urocanate hydratase  57.87 
 
 		 557 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99976  normal  0.401042 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1893  urocanate hydratase  58.02 
 
 		 550 aa  671    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3661  urocanate hydratase  64.74 
 
 		 552 aa  721    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2399  urocanate hydratase  62.88 
 
 		 553 aa  719    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3902  urocanate hydratase  56.63 
 
 		 563 aa  643    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.736698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5833  urocanate hydratase  57.17 
 
 		 559 aa  646    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3684  urocanate hydratase  64.74 
 
 		 552 aa  723    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2311  urocanate hydratase  64.2 
 
 		 552 aa  714    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.599874  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4086  urocanate hydratase  56.94 
 
 		 563 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1461  urocanate hydratase  58.38 
 
 		 549 aa  650    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.801738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0805  urocanate hydratase  58.44 
 
 		 593 aa  661    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2475  urocanate hydratase  55.19 
 
 		 572 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.638897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26180  urocanate hydratase  56.6 
 
 		 559 aa  631  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.60353  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1691  urocanate hydratase  56.55 
 
 		 553 aa  634  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0150  urocanate hydratase  56.43 
 
 		 577 aa  632  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0854  urocanate hydratase  55.4 
 
 		 561 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2881  urocanate hydratase  55.29 
 
 		 572 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1110  urocanate hydratase  57.19 
 
 		 549 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4169  urocanate hydratase  56.76 
 
 		 562 aa  634  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2647  urocanate hydratase  53.39 
 
 		 601 aa  628  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.147461  normal  0.780355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1164  urocanate hydratase  56.66 
 
 		 572 aa  631  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0083  urocanate hydratase  57.14 
 
 		 564 aa  629  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0102  urocanate hydratase  57.19 
 
 		 555 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3953  urocanate hydratase  56.47 
 
 		 556 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4397  urocanate hydratase  59.28 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458241  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0885  urocanate hydratase  55.22 
 
 		 561 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0159  urocanate hydratase  55.81 
 
 		 572 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0097  urocanate hydratase  57.22 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4447  urocanate hydratase  57.14 
 
 		 556 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1334  urocanate hydratase  54.25 
 
 		 554 aa  626  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1330  urocanate hydratase  53.89 
 
 		 554 aa  625  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4838  urocanate hydratase  56.6 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1021  urocanate hydratase  55.33 
 
 		 566 aa  626  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2964  urocanate hydratase  56.17 
 
 		 574 aa  627  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0164648  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4252  urocanate hydratase  57.04 
 
 		 555 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0079  urocanate hydratase  57.01 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2315  urocanate hydratase  59.06 
 
 		 546 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641522  normal  0.0309572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0102  urocanate hydratase  57.04 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1812  urocanate hydratase  56.06 
 
 		 562 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596639  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0097  urocanate hydratase  56.86 
 
 		 556 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0647  urocanate hydratase  57.32 
 
 		 562 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2794  urocanate hydratase  57.32 
 
 		 562 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5480  urocanate hydratase  56.42 
 
 		 562 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1822  urocanate hydratase  57.32 
 
 		 562 aa  625  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5907  urocanate hydratase  56.42 
 
 		 562 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1601  urocanate hydratase  58.23 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.308587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2170  urocanate hydratase  56.42 
 
 		 562 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.337819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2364  urocanate hydratase  57.32 
 
 		 562 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.738454  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0852  urocanate hydratase  54.16 
 
 		 573 aa  622  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.371029  hitchhiker  0.00893346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1773  Urocanate hydratase  59.67 
 
 		 551 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0949014 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>