182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4043 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5033  urocanate hydratase  57.45 
 
 
557 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0629  urocanate hydratase  59.27 
 
 
552 aa  648    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3679  urocanate hydratase  62.68 
 
 
552 aa  701    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2819  urocanate hydratase  60.73 
 
 
549 aa  663    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5270  urocanate hydratase  57.4 
 
 
607 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3441  urocanate hydratase  62.68 
 
 
552 aa  701    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3404  urocanate hydratase  62.68 
 
 
552 aa  701    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3353  urocanate hydratase  62.86 
 
 
552 aa  702    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4828  urocanate hydratase  57.22 
 
 
565 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3338  urocanate hydratase  63.21 
 
 
552 aa  706    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204874  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5083  urocanate hydratase  57.45 
 
 
557 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34014  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3711  urocanate hydratase  62.68 
 
 
552 aa  701    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0342728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3641  urocanate hydratase  59.09 
 
 
551 aa  651    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278935  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2854  urocanate hydratase  56.68 
 
 
568 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1048  urocanate hydratase  59.24 
 
 
557 aa  664    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.155699  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0583  urocanate hydratase  61.82 
 
 
554 aa  662    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2159  urocanate hydratase  60.33 
 
 
551 aa  665    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4107  urocanate hydratase  76.85 
 
 
598 aa  931    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1593  urocanate hydratase  60.36 
 
 
554 aa  652    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67350  urocanate hydratase  57.09 
 
 
559 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2376  urocanate hydratase  60.73 
 
 
570 aa  669    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0431  urocanate hydratase  56.73 
 
 
557 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145771  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4169  urocanate hydratase  57.5 
 
 
562 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4043  urocanate hydratase  100 
 
 
585 aa  1204    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3834  urocanate hydratase  86.28 
 
 
595 aa  1002    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4252  urocanate hydratase  58.05 
 
 
555 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1282  urocanate hydratase  61.13 
 
 
552 aa  681    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0391092  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1522  urocanate hydratase  56.73 
 
 
549 aa  645    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.492365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0100  urocanate hydratase  57.32 
 
 
551 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.431481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0253  urocanate hydratase  57.92 
 
 
556 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3759  urocanate hydratase  63.04 
 
 
552 aa  704    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2356  urocanate hydratase  63.27 
 
 
553 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1557  urocanate hydratase  62.68 
 
 
552 aa  705    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0743786  normal  0.0292483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4907  urocanate hydratase  57.45 
 
 
557 aa  648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99976  normal  0.401042 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1893  urocanate hydratase  57.09 
 
 
550 aa  660    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2399  urocanate hydratase  63.27 
 
 
553 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5833  urocanate hydratase  56.32 
 
 
559 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3684  urocanate hydratase  62.68 
 
 
552 aa  701    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2311  urocanate hydratase  63.09 
 
 
552 aa  700    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.599874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4552  urocanate hydratase  56.13 
 
 
558 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3661  urocanate hydratase  62.86 
 
 
552 aa  702    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0805  urocanate hydratase  57.09 
 
 
593 aa  646    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392094  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5048  urocanate hydratase  56.31 
 
 
559 aa  634  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0102  urocanate hydratase  57.71 
 
 
555 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0102  urocanate hydratase  58.05 
 
 
555 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4138  urocanate hydratase  56.73 
 
 
568 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0076  urocanate hydratase  56.73 
 
 
563 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4070  urocanate hydratase  56 
 
 
553 aa  632  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0097  urocanate hydratase  58.05 
 
 
555 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4086  urocanate hydratase  56.73 
 
 
563 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1461  urocanate hydratase  57.27 
 
 
549 aa  634  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.801738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4447  urocanate hydratase  57.5 
 
 
556 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2715  urocanate hydratase  56.14 
 
 
566 aa  631  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0360  urocanate hydratase  55.54 
 
 
560 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3000  urocanate hydratase  58.3 
 
 
558 aa  630  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136861  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2641  urocanate hydratase  57.04 
 
 
561 aa  630  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.990677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0083  urocanate hydratase  57.35 
 
 
564 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0150  urocanate hydratase  56.17 
 
 
577 aa  630  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4397  urocanate hydratase  60.07 
 
 
555 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458241  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0079  urocanate hydratase  57.89 
 
 
555 aa  631  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3902  urocanate hydratase  55.25 
 
 
563 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.736698  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3618  urocanate hydratase  59.86 
 
 
551 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0116497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0896  urocanate hydratase  55.45 
 
 
557 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5636  urocanate hydratase  55.45 
 
 
559 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1042  urocanate hydratase  55.58 
 
 
579 aa  627  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0991609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4838  urocanate hydratase  55.81 
 
 
556 aa  626  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2881  urocanate hydratase  56.01 
 
 
572 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3953  urocanate hydratase  56.91 
 
 
556 aa  628  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0159  urocanate hydratase  55.4 
 
 
572 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2475  urocanate hydratase  56.01 
 
 
572 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.638897  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1110  urocanate hydratase  57.64 
 
 
549 aa  627  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4630  urocanate hydratase  56.31 
 
 
555 aa  628  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324948  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1334  urocanate hydratase  54.18 
 
 
554 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1330  urocanate hydratase  54 
 
 
554 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1930  urocanate hydratase  55.3 
 
 
572 aa  624  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1812  urocanate hydratase  55.82 
 
 
562 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596639  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1265  urocanate hydratase  56.12 
 
 
563 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0099  urocanate hydratase  56.42 
 
 
556 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0094  urocanate hydratase  56.42 
 
 
556 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0100  urocanate hydratase  56.6 
 
 
556 aa  625  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2964  urocanate hydratase  56.27 
 
 
574 aa  623  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0164648  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1263  urocanate hydratase  55.64 
 
 
561 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776789  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1749  urocanate hydratase  57.38 
 
 
556 aa  623  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0097  urocanate hydratase  56.42 
 
 
556 aa  620  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1822  urocanate hydratase  56.55 
 
 
562 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1164  urocanate hydratase  56.01 
 
 
572 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1414  urocanate hydratase  56 
 
 
552 aa  619  1e-176  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.359346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1021  urocanate hydratase  55.54 
 
 
566 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0707  urocanate hydratase  56.18 
 
 
564 aa  619  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.760092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0940  urocanate hydratase  55.09 
 
 
561 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00715979  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2647  urocanate hydratase  53.94 
 
 
601 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.147461  normal  0.780355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0909  urocanate hydratase  56.67 
 
 
564 aa  615  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2794  urocanate hydratase  56.55 
 
 
562 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2936  urocanase  57.07 
 
 
908 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5480  urocanate hydratase  56 
 
 
562 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1773  Urocanate hydratase  59.13 
 
 
551 aa  616  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0949014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0917  urocanate hydratase  55.09 
 
 
561 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0937043  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0826  urocanate hydratase  55.09 
 
 
561 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0852  urocanate hydratase  54.45 
 
 
573 aa  617  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.371029  hitchhiker  0.00893346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6265  urocanate hydratase  60.22 
 
 
548 aa  616  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>