182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4107 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0629  urocanate hydratase  58.14 
 
 
552 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2159  urocanate hydratase  58.98 
 
 
551 aa  658    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3679  urocanate hydratase  60.77 
 
 
552 aa  684    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3441  urocanate hydratase  60.6 
 
 
552 aa  684    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3404  urocanate hydratase  60.77 
 
 
552 aa  685    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3353  urocanate hydratase  60.77 
 
 
552 aa  684    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1522  urocanate hydratase  55.03 
 
 
549 aa  635    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.492365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3338  urocanate hydratase  60.77 
 
 
552 aa  686    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3684  urocanate hydratase  60.77 
 
 
552 aa  685    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414953  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3711  urocanate hydratase  60.6 
 
 
552 aa  684    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0342728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2819  urocanate hydratase  59.86 
 
 
549 aa  658    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1282  urocanate hydratase  59.37 
 
 
552 aa  670    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0391092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1048  urocanate hydratase  57.09 
 
 
557 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.155699  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3641  urocanate hydratase  58.84 
 
 
551 aa  652    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278935  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0583  urocanate hydratase  60.63 
 
 
554 aa  664    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4107  urocanate hydratase  100 
 
 
598 aa  1227    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3834  urocanate hydratase  76.38 
 
 
595 aa  919    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2376  urocanate hydratase  57.67 
 
 
570 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1557  urocanate hydratase  60.6 
 
 
552 aa  687    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0743786  normal  0.0292483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1593  urocanate hydratase  58.84 
 
 
554 aa  642    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2356  urocanate hydratase  59.19 
 
 
553 aa  699    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3759  urocanate hydratase  60.6 
 
 
552 aa  683    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1893  urocanate hydratase  56.04 
 
 
550 aa  652    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2399  urocanate hydratase  59.19 
 
 
553 aa  699    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4043  urocanate hydratase  77.52 
 
 
585 aa  952    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2311  urocanate hydratase  60.77 
 
 
552 aa  686    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.599874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3661  urocanate hydratase  60.77 
 
 
552 aa  685    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2854  urocanate hydratase  54.89 
 
 
568 aa  634  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289939  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0100  urocanate hydratase  56.25 
 
 
551 aa  633  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.431481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67350  urocanate hydratase  55.24 
 
 
559 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3618  urocanate hydratase  59.58 
 
 
551 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0805  urocanate hydratase  55.17 
 
 
593 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392094  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5033  urocanate hydratase  54.99 
 
 
557 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5083  urocanate hydratase  54.99 
 
 
557 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34014  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1263  urocanate hydratase  54.82 
 
 
561 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4630  urocanate hydratase  55.46 
 
 
555 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324948  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4907  urocanate hydratase  54.99 
 
 
557 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99976  normal  0.401042 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1461  urocanate hydratase  56.22 
 
 
549 aa  630  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.801738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3000  urocanate hydratase  57.04 
 
 
558 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136861  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5270  urocanate hydratase  54.96 
 
 
607 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4828  urocanate hydratase  54.96 
 
 
565 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2715  urocanate hydratase  54.37 
 
 
566 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0360  urocanate hydratase  54.43 
 
 
560 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0253  urocanate hydratase  56.04 
 
 
556 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0431  urocanate hydratase  54.82 
 
 
557 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145771  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0102  urocanate hydratase  56.54 
 
 
555 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4552  urocanate hydratase  53.94 
 
 
558 aa  628  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0102  urocanate hydratase  56.54 
 
 
555 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4252  urocanate hydratase  56.54 
 
 
555 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4138  urocanate hydratase  54.29 
 
 
568 aa  625  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3902  urocanate hydratase  54.51 
 
 
563 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.736698  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0097  urocanate hydratase  56.54 
 
 
555 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0076  urocanate hydratase  54.29 
 
 
563 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1334  urocanate hydratase  52.23 
 
 
554 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0896  urocanate hydratase  54.64 
 
 
557 aa  624  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5636  urocanate hydratase  54.47 
 
 
559 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5048  urocanate hydratase  54.66 
 
 
559 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1414  urocanate hydratase  54.98 
 
 
552 aa  622  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.359346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1110  urocanate hydratase  56.39 
 
 
549 aa  624  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4070  urocanate hydratase  54.29 
 
 
553 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4086  urocanate hydratase  54.29 
 
 
563 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1330  urocanate hydratase  52.06 
 
 
554 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0083  urocanate hydratase  56.12 
 
 
564 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1295  urocanate hydratase  54.75 
 
 
554 aa  618  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0784383  normal  0.0497778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0079  urocanate hydratase  56.2 
 
 
555 aa  621  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5833  urocanate hydratase  54.34 
 
 
559 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0097  urocanate hydratase  55.87 
 
 
556 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1021  urocanate hydratase  54.22 
 
 
566 aa  615  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0917  urocanate hydratase  53.95 
 
 
561 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0937043  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0940  urocanate hydratase  53.95 
 
 
561 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00715979  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0854  urocanate hydratase  53.78 
 
 
561 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26180  urocanate hydratase  54.82 
 
 
559 aa  618  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.60353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4169  urocanate hydratase  55.34 
 
 
562 aa  617  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1532  urocanate hydratase  54.7 
 
 
562 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0826  urocanate hydratase  53.95 
 
 
561 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4447  urocanate hydratase  55.52 
 
 
556 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2086  urocanate hydratase  54.36 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951228  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2794  urocanate hydratase  54.88 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5480  urocanate hydratase  54.53 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1822  urocanate hydratase  54.7 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2187  urocanate hydratase  54.36 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155739  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1042  urocanate hydratase  52.08 
 
 
579 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0991609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2945  urocanate hydratase  54.36 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1812  urocanate hydratase  53.66 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596639  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5907  urocanate hydratase  54.36 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1100  urocanate hydratase  54.53 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103939  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2209  urocanate hydratase  54.36 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2170  urocanate hydratase  54.36 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.337819  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0100  urocanate hydratase  55.69 
 
 
556 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5956  urocanate hydratase  54.47 
 
 
557 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0885  urocanate hydratase  53.78 
 
 
561 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6265  urocanate hydratase  59.02 
 
 
548 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2721  urocanate hydratase  54.88 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0159  urocanate hydratase  53.62 
 
 
572 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2641  urocanate hydratase  53.99 
 
 
561 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.990677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2475  urocanate hydratase  53.4 
 
 
572 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.638897  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4656  urocanate hydratase  55.15 
 
 
559 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312199  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2881  urocanate hydratase  53.23 
 
 
572 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4397  urocanate hydratase  57.09 
 
 
555 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2364  urocanate hydratase  54.88 
 
 
562 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.738454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>