134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0494 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0494  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  632  1e-180  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0951718  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1346  hypothetical protein  67.54 
 
 
307 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0324  hypothetical protein  64.05 
 
 
306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.291664  normal  0.0239174 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1224  hypothetical protein  55.45 
 
 
305 aa  348  7e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0350  hypothetical protein  44.19 
 
 
313 aa  255  7e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1465  hypothetical protein  39.19 
 
 
292 aa  204  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0871  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.55 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0784553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2911  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.32 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.36 
 
 
656 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  26.46 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0470  hypothetical protein  26.61 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  27.35 
 
 
639 aa  70.1  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  30.6 
 
 
617 aa  69.3  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  25.22 
 
 
643 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.32 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.1 
 
 
656 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.32 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  25.89 
 
 
549 aa  66.2  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.32 
 
 
698 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  25.73 
 
 
390 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.22 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  26.42 
 
 
615 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25 
 
 
699 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  27.27 
 
 
658 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0545  hypothetical protein  25.11 
 
 
588 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.29 
 
 
713 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  25.44 
 
 
659 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.96 
 
 
658 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2723  hypothetical protein  27.48 
 
 
641 aa  58.9  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  23.33 
 
 
703 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  22.86 
 
 
703 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.22 
 
 
629 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.27 
 
 
676 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  22.86 
 
 
703 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.32 
 
 
658 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  22.86 
 
 
629 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  22.86 
 
 
703 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  22.86 
 
 
703 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  22.86 
 
 
703 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  22.86 
 
 
703 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  22.86 
 
 
703 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  25.42 
 
 
654 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  24.12 
 
 
655 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  25.24 
 
 
699 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4896  hypothetical protein  26.16 
 
 
650 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395203  normal  0.74481 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  22.86 
 
 
703 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  22.86 
 
 
703 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  27.86 
 
 
1015 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  25 
 
 
654 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  24.29 
 
 
752 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0311  iron-sulfur cluster-binding protein  25.79 
 
 
650 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0857951  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2072  hypothetical protein  25.7 
 
 
423 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0332  hypothetical protein  25.79 
 
 
650 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0251968  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  26.54 
 
 
727 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0334  hypothetical protein  25.79 
 
 
650 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0384871  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25 
 
 
737 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  24.29 
 
 
652 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  26.07 
 
 
730 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.88 
 
 
655 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.23 
 
 
722 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  25.11 
 
 
716 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  26.96 
 
 
692 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.76 
 
 
717 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  22.96 
 
 
678 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  27.32 
 
 
739 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  23.91 
 
 
661 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0903  hypothetical protein  27.22 
 
 
367 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.55 
 
 
661 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0397  iron-sulfur cluster-binding protein  25.85 
 
 
669 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.87 
 
 
661 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  23.58 
 
 
661 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.39 
 
 
662 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  24.44 
 
 
720 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.39 
 
 
662 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1499  heterodisulfide reductase, subunit D  26.64 
 
 
382 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0669416  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5222  hypothetical protein  25.91 
 
 
649 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064431  hitchhiker  0.00288183 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  24.38 
 
 
1015 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1873  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.24 
 
 
390 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  23.67 
 
 
671 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.17 
 
 
694 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71280  putative ferredoxin  26.01 
 
 
653 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.960702  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  22 
 
 
375 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.82 
 
 
686 aa  49.7  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25 
 
 
721 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4016  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.44 
 
 
265 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112727  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0768  hypothetical protein  28.18 
 
 
385 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.23 
 
 
664 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.23 
 
 
664 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  27.27 
 
 
688 aa  49.3  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  21.15 
 
 
730 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.83 
 
 
743 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.66 
 
 
663 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5100  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.11 
 
 
373 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436212  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4016  iron-sulfur cluster-binding protein  23.64 
 
 
661 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  25.1 
 
 
661 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4054  hypothetical protein  25.97 
 
 
632 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363818  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2479  hypothetical protein  25.53 
 
 
631 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3299  hypothetical protein  26.36 
 
 
639 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753442  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.23 
 
 
387 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.77 
 
 
714 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>