180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1224 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1224  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  618  1e-176  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1346  hypothetical protein  58.17 
 
 
307 aa  377  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0324  hypothetical protein  61.56 
 
 
306 aa  369  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.291664  normal  0.0239174 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0494  hypothetical protein  55.45 
 
 
310 aa  348  7e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0951718  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0350  hypothetical protein  45.66 
 
 
313 aa  269  4e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1465  hypothetical protein  44.08 
 
 
292 aa  228  7e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0871  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.89 
 
 
299 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0784553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2911  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.19 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.87 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  29.91 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.55 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  30.77 
 
 
654 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.36 
 
 
722 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  30.77 
 
 
639 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.61 
 
 
713 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.8 
 
 
698 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.72 
 
 
655 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.09 
 
 
699 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.51 
 
 
658 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  29.46 
 
 
659 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  29.78 
 
 
617 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  30.66 
 
 
615 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.39 
 
 
676 aa  73.9  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.35 
 
 
661 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  32.14 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.2 
 
 
661 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  28.96 
 
 
703 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.19 
 
 
658 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  28.64 
 
 
703 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.8 
 
 
662 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  28.64 
 
 
703 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  28.07 
 
 
661 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  28.64 
 
 
703 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  28.64 
 
 
703 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  28.64 
 
 
703 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  28.64 
 
 
703 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  27.52 
 
 
549 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.99 
 
 
629 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  28.64 
 
 
703 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  28.64 
 
 
629 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  28.18 
 
 
703 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  28.64 
 
 
703 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.35 
 
 
662 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.35 
 
 
664 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  27.63 
 
 
652 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  29.15 
 
 
663 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  28.63 
 
 
658 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28 
 
 
656 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.86 
 
 
664 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28 
 
 
656 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  28.44 
 
 
655 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2479  hypothetical protein  29.17 
 
 
631 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.48 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  28.07 
 
 
661 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.67 
 
 
686 aa  65.9  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  26.64 
 
 
730 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  27.07 
 
 
727 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  27.15 
 
 
643 aa  65.9  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  26.99 
 
 
692 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0545  hypothetical protein  27.93 
 
 
588 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.98 
 
 
712 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4016  iron-sulfur cluster-binding protein  27.73 
 
 
661 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  26.8 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  25.22 
 
 
678 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  29.82 
 
 
739 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  27.91 
 
 
661 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  27.75 
 
 
654 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0768  hypothetical protein  28.89 
 
 
385 aa  62.4  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  27.68 
 
 
661 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.66 
 
 
711 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.43 
 
 
694 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  28 
 
 
661 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4896  hypothetical protein  31.43 
 
 
650 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395203  normal  0.74481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  26.99 
 
 
671 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  25.66 
 
 
711 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2723  hypothetical protein  30.84 
 
 
641 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  28.07 
 
 
716 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0311  iron-sulfur cluster-binding protein  31.16 
 
 
650 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0857951  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0334  hypothetical protein  31.16 
 
 
650 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0384871  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0123  Fe-S oxidoreductase, dehydrogenase subunit  25.22 
 
 
262 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.920784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4040  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.31 
 
 
633 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206546  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0332  hypothetical protein  31.16 
 
 
650 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0251968  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3550  hypothetical protein  30.6 
 
 
641 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.42 
 
 
743 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0952  hypothetical protein  26.42 
 
 
365 aa  59.7  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3745  hypothetical protein  26.85 
 
 
633 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0847485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  26 
 
 
720 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  23.46 
 
 
752 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02034  hypothetical protein  29.08 
 
 
641 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.89 
 
 
663 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0575  hypothetical protein  29.85 
 
 
641 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.22 
 
 
711 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2003  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.32 
 
 
412 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0747762  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.36 
 
 
737 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5887  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.89 
 
 
259 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.11 
 
 
683 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4000  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.39 
 
 
632 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  27.45 
 
 
699 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  27.07 
 
 
688 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>