21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2074 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  100 
 
 		 1193 aa  2331    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  87.18 
 
 		 1193 aa  2008    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1190 aa  282  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  27.94 
 
 		 755 aa  194  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  25.76 
 
 		 944 aa  146  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1279 aa  145  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  27.23 
 
 		 1327 aa  106  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  27.66 
 
 		 1332 aa  102  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1249 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  24.66 
 
 		 942 aa  99.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  27.92 
 
 		 1332 aa  93.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1345 aa  89  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1903  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1062 aa  88.2  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1735  tetratricopeptide TPR_4  26.09 
 
 		 900 aa  87.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1296 aa  84  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1306 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  26.7 
 
 		 1343 aa  82.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1368 aa  75.5  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0341  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 752 aa  51.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1963  putative signal peptide protein  32.14 
 
 		 299 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.789583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 503 aa  44.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>