18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5545 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1279 aa  2556    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  46 
 
 		 1296 aa  998    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  29.41 
 
 		 1332 aa  365  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  29.32 
 
 		 1343 aa  358  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  27.03 
 
 		 1332 aa  322  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1306 aa  309  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1368 aa  296  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 1249 aa  268  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  27.09 
 
 		 1327 aa  263  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  26.53 
 
 		 944 aa  233  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  25.39 
 
 		 942 aa  207  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1345 aa  171  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1190 aa  138  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1193 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  25 
 
 		 1193 aa  100  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  23.88 
 
 		 755 aa  89  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0537  hypothetical protein  20.95 
 
 		 942 aa  72  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00112952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1735  tetratricopeptide TPR_4  24.5 
 
 		 900 aa  56.2  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>