19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2080 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 1343 aa  2682    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  42.13 
 
 		 1327 aa  955    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 1306 aa  900    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  41.55 
 
 		 1332 aa  932    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  45.36 
 
 		 1368 aa  1102    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  77.16 
 
 		 1332 aa  1945    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 1296 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1279 aa  348  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1345 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  25.96 
 
 		 944 aa  235  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  27.34 
 
 		 942 aa  151  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 		 1249 aa  133  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0537  hypothetical protein  23.67 
 
 		 942 aa  103  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00112952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1193 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1190 aa  93.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3206  putative signal peptide protein  32.06 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1193 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  26.29 
 
 		 755 aa  70.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1963  putative signal peptide protein  25.81 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.789583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>