22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1042 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  45.29 
 
 		 1279 aa  971    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  58.97 
 
 		 1296 aa  1475    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1345 aa  2662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  29.16 
 
 		 1343 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  27.18 
 
 		 1332 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  29.9 
 
 		 1332 aa  293  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1306 aa  289  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  27.85 
 
 		 1327 aa  244  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  26.76 
 
 		 944 aa  244  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1368 aa  243  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  26.69 
 
 		 942 aa  220  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1249 aa  172  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1190 aa  166  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1193 aa  76.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  23.9 
 
 		 755 aa  74.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3206  putative signal peptide protein  31.46 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1193 aa  67  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0537  hypothetical protein  22.83 
 
 		 942 aa  63.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00112952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1963  putative signal peptide protein  23.51 
 
 		 299 aa  51.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.789583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0536  hypothetical protein  39.19 
 
 		 387 aa  50.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.120824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1903  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 1062 aa  50.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1735  tetratricopeptide TPR_4  22.64 
 
 		 900 aa  50.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>