16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1646 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  100 
 
 		 755 aa  1535    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1190 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1193 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1193 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  23.84 
 
 		 944 aa  92  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 1279 aa  84  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  23.75 
 
 		 1327 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  22.46 
 
 		 1332 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  23.21 
 
 		 942 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1296 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 1345 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1306 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  26.83 
 
 		 1332 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1249 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  21.11 
 
 		 1343 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  23 
 
 		 1368 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>