20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2441 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  100 
 
 
1190 aa  2415    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  35.48 
 
 
755 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  26.91 
 
 
1193 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  25.84 
 
 
1193 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 
1296 aa  184  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 
1345 aa  159  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  23.4 
 
 
1327 aa  153  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
1249 aa  150  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  23.02 
 
 
1332 aa  142  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  23.22 
 
 
944 aa  140  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  22.78 
 
 
942 aa  132  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 
1306 aa  127  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 
1279 aa  123  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  24.24 
 
 
1332 aa  101  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  24.33 
 
 
1368 aa  95.9  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  25.97 
 
 
1343 aa  92.8  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1903  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 
1062 aa  83.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1735  tetratricopeptide TPR_4  23.82 
 
 
900 aa  81.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0537  hypothetical protein  23.06 
 
 
942 aa  58.2  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00112952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.29 
 
 
810 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>