17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3205 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  100 
 
 		 942 aa  1870    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  35.55 
 
 		 944 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1306 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1296 aa  233  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1345 aa  220  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 1249 aa  212  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1279 aa  202  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1368 aa  168  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  31.84 
 
 		 1332 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  28.5 
 
 		 1332 aa  155  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  28.26 
 
 		 1327 aa  152  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  27.34 
 
 		 1343 aa  152  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0537  hypothetical protein  21.49 
 
 		 942 aa  150  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00112952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1190 aa  137  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1193 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1193 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  23.21 
 
 		 755 aa  78.2  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>