19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5289 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  40.92 
 
 		 1343 aa  884    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  34.87 
 
 		 1327 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1306 aa  2630    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  34.1 
 
 		 1332 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  37.3 
 
 		 1368 aa  800    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  41.17 
 
 		 1332 aa  865    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 1296 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 1279 aa  325  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1345 aa  281  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  27.45 
 
 		 942 aa  238  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  26.21 
 
 		 944 aa  235  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1249 aa  222  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1190 aa  127  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0537  hypothetical protein  24.6 
 
 		 942 aa  90.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00112952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3206  putative signal peptide protein  29.59 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1193 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1963  putative signal peptide protein  25.52 
 
 		 299 aa  70.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.789583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  23.75 
 
 		 755 aa  68.6  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1193 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>