18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1964 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  100 
 
 		 944 aa  1911    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  35.55 
 
 		 942 aa  539  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  28.56 
 
 		 1296 aa  244  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1345 aa  239  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1306 aa  230  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  26.26 
 
 		 1343 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1279 aa  217  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  25.5 
 
 		 1327 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1249 aa  205  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  25.11 
 
 		 1332 aa  194  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1368 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1193 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  27.51 
 
 		 1332 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1190 aa  140  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0537  hypothetical protein  21.87 
 
 		 942 aa  140  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00112952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1193 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  23.84 
 
 		 755 aa  92  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1735  tetratricopeptide TPR_4  25.18 
 
 		 900 aa  57  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>