14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0537 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0537  hypothetical protein  100 
 
 		 942 aa  1878    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00112952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  21.38 
 
 		 942 aa  163  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  21.97 
 
 		 944 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  23.7 
 
 		 1332 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  23.67 
 
 		 1343 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 1296 aa  109  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  24.82 
 
 		 1332 aa  104  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  24.36 
 
 		 1327 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1306 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1368 aa  91.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  20.95 
 
 		 1279 aa  85.5  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  18.75 
 
 		 1249 aa  77  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 1345 aa  71.2  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1190 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>