264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1924 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1924  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  100 
 
 
186 aa  376  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407385  unclonable  0.000000287357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1500  GCN5-related N-acetyltransferase  61.93 
 
 
184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3618  GCN5-related N-acetyltransferase  57.39 
 
 
198 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2353  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
196 aa  167  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0665261  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1133  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0245  GCN5-related N-acetyltransferase  45.09 
 
 
203 aa  161  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0543  GCN5-related N-acetyltransferase  54.09 
 
 
197 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.176877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0575  GCN5-related N-acetyltransferase  53.46 
 
 
197 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0572  GCN5-related N-acetyltransferase  52.83 
 
 
197 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 
185 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000192346  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1269  GCN5-related N-acetyltransferase  50.32 
 
 
197 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0750  GCN5-related N-acetyltransferase  48.72 
 
 
176 aa  154  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1813  Phosphinothricin acetyltransferase  46.75 
 
 
198 aa  152  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0287  GCN5-related N-acetyltransferase  43.58 
 
 
184 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1276  phosphinothricin acetyltransferase, putative  47.4 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1827  phosphinothricin N-acetyltransferase  42.76 
 
 
163 aa  147  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2038  Phosphinothricin acetyltransferase  47.44 
 
 
175 aa  147  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1948  sortase related acyltransferase  42.21 
 
 
186 aa  145  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2224  Phosphinothricin acetyltransferase  44.07 
 
 
198 aa  143  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0523  GCN5-related N-acetyltransferase  48.19 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142872  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2571  phosphinothricin N-acetyltransferase  39.63 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209959  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21300  sortase-like acyltransferase  40.64 
 
 
210 aa  131  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1935  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
199 aa  126  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.775828  normal  0.0634472 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1335  sortase related acyltransferase  36.31 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000322304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4405  Phosphinothricin acetyltransferase  47.65 
 
 
190 aa  125  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2732  GCN5-related N-acetyltransferase  37.82 
 
 
190 aa  125  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3936  GCN5-related N-acetyltransferase  48.12 
 
 
176 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0390446  decreased coverage  0.000407903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1342  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  38.12 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.952982  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0082  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1356  GCN5-related N-acetyltransferase  40.37 
 
 
181 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.181273  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00641  phosphinothricin N-acetyltransferase  44.37 
 
 
170 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2366  GCN5-related N-acetyltransferase  36.93 
 
 
213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  39.52 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  38.76 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  39.08 
 
 
186 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  41.4 
 
 
210 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1369  Phosphinothricin acetyltransferase  44.06 
 
 
177 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  38.18 
 
 
209 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09090  sortase-like acyltransferase  33.7 
 
 
185 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.749785  normal  0.431101 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
193 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3467  Phosphinothricin acetyltransferase  47.5 
 
 
193 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  normal  0.21484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.65 
 
 
179 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
184 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  41.67 
 
 
247 aa  104  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  41.67 
 
 
247 aa  104  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  41.67 
 
 
247 aa  104  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  38.85 
 
 
206 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.65 
 
 
179 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3321  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.24 
 
 
179 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0173112  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1301  phosphinothricin N-acetyltransferase  41.67 
 
 
210 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 
186 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.522089 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0284  phosphinothricin N-acetyltransferase  41.67 
 
 
247 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0554  phosphinothricin N-acetyltransferase  41.67 
 
 
247 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1014  phosphinothricin N-acetyltransferase  41.67 
 
 
188 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2733  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
184 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2090  phosphinothricin acetyltransferase, putative  35.76 
 
 
164 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
179 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1467  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.46 
 
 
188 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 
186 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4669  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 
186 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  38.92 
 
 
167 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0856381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2407  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
195 aa  101  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  36.22 
 
 
185 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  39.49 
 
 
174 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  37.28 
 
 
181 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1689  GCN5-related N-acetyltransferase  38.31 
 
 
178 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  38.65 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1787  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  39.26 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000010061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
186 aa  98.6  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
163 aa  99  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4059  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
207 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0540643  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1883  GCN5-related N-acetyltransferase  39.35 
 
 
197 aa  99  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.278862  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
163 aa  99  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00885  phosphinothricin N-acetyltransferase  38.06 
 
 
179 aa  98.6  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  37.82 
 
 
180 aa  97.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1606  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0984019  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
188 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00313605  hitchhiker  0.0000000000000200087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4882  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256707  normal  0.880249 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  38.65 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210755  normal  0.806566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0345136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
173 aa  95.5  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
181 aa  95.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3356  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
173 aa  94.7  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1472  Phosphinothricin acetyltransferase  36.54 
 
 
174 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
185 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4517  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
187 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.729154  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1921  Phosphinothricin acetyltransferase  30.18 
 
 
165 aa  92  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  35.15 
 
 
176 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
185 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1103  putative phosphinothricin acetyltransferase  34.52 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0397  phosphinothricin acetyltransferase protein  38.06 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456114  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5129  GCN5-related N-acetyltransferase  37.34 
 
 
175 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601206  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1401  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>