More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42457 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_42457  predicted protein  100 
 
 		 468 aa  962    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0535251 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02706  cytochrome P450, putative (Eurofung)  40 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.290091 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02607  cytochrome P450, putative (Eurofung)  25.97 
 
 		 505 aa  193  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  0.314909 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11142  cytochrome P450, putative (Eurofung)  25.15 
 
 		 549 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  23.33 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  25.19 
 
 		 461 aa  93.2  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  23.43 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  25.19 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  23.88 
 
 		 463 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  23.6 
 
 		 508 aa  90.9  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  26.77 
 
 		 471 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  22.49 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  26.18 
 
 		 471 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  26.03 
 
 		 1075 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  24.11 
 
 		 1059 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  22.56 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  23.11 
 
 		 441 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  20.95 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  21.68 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03225  cytochrome P450, putative (Eurofung)  22.16 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.881361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  23.68 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  22.74 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  31.98 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  30.66 
 
 		 1074 aa  83.2  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  24.75 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  23.74 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  22.5 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  22.47 
 
 		 769 aa  81.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  22.33 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  21.74 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09296  cytochrome P450, putative (Eurofung)  23.42 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  30.38 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  22.57 
 
 		 599 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  25.97 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  22.8 
 
 		 560 aa  80.1  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  22.04 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  21.62 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37142  Cytochrome P450 52A3 (CYPLIIA3) (Alkane-inducible P450-ALK1-A) (P450-CM1) (CYP52A3-A) (Cytochrome P-450ALK)  22.65 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09210  cytochrome P450, putative (Eurofung)  21.08 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  20.99 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50101  lutein deficient 1-like protein  21.38 
 
 		 644 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  25.65 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10617  cytochrome P450, putative (Eurofung)  22.79 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2227  cytochrome P450  24.64 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0961  cytochrome P450 enzyme  24.51 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  21.31 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  34.21 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  21.56 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  22.04 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  21.57 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  34.21 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  21.56 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09384  cytochrome P450, putative (Eurofung)  28.91 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284157  normal  0.464861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  22.76 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  23.83 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  27.83 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  23.39 
 
 		 1365 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07131  cytochrome P450, putative (Eurofung)  27.96 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal  0.0135505 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42499  predicted protein  23.71 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.439591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  29.66 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  23.08 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  22.51 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  24.89 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  23.37 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  28.57 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02610  cytochrome P450, putative (Eurofung)  31.58 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000244519  normal  0.0264899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  25.84 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  23.62 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  24.15 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  25.49 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  27.83 
 
 		 1083 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  22.92 
 
 		 1373 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  23.37 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  23.16 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  22.92 
 
 		 1373 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  24 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  24 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  22.92 
 
 		 1373 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  22.92 
 
 		 1373 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  21.1 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58031  Cytochrome P450 52A13 (Alkane hydroxylase 2) (Alkane-inducible p450alk 2) (DH-ALK2)  30.35 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  22.92 
 
 		 1373 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01310  Cytochrome P450, putative  22.02 
 
 		 582 aa  73.9  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  22.92 
 
 		 1373 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  22.2 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  22.92 
 
 		 1373 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06449  cytochrome P450, putative (Eurofung)  26.7 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  22.98 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  21.91 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  30 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  21.59 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07522  cytochrome P450, putative (Eurofung)  23.02 
 
 		 501 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.334119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  22.66 
 
 		 1380 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  22.4 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56638  Cytochrome P450 52A12 (Alkane hydroxylase 1) (Alkane-inducible p450alk 1) (DH-ALK2)  29.29 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  23.54 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05665  cytochrome P450, putative (Eurofung)  35.34 
 
 		 516 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  27.03 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56580  Cytochrome P450 52A6 (CYPLIIA6) (Alkane-inducible P450-ALK3)  28.77 
 
 		 515 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.137821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  27.03 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.100989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>