259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40839 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_40839  vacuolar metal transporter  100 
 
 
523 aa  1066    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00844793 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84655  manganese transporter  44.77 
 
 
531 aa  426  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.047618  normal  0.19959 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05633  transporter protein smf2 (AFU_orthologue; AFUA_4G10990)  46.29 
 
 
597 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.872835 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53486  manganese ion transporter  48.51 
 
 
698 aa  414  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.392071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  38.9 
 
 
463 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  37.47 
 
 
450 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  36.08 
 
 
429 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  37.44 
 
 
450 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  34.54 
 
 
453 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  36.53 
 
 
426 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  35.96 
 
 
462 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  36.3 
 
 
456 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  36.11 
 
 
460 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  36.53 
 
 
456 aa  248  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  34.8 
 
 
447 aa  246  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  35.51 
 
 
450 aa  243  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  35.31 
 
 
453 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  34.3 
 
 
444 aa  240  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  35.47 
 
 
448 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  34.76 
 
 
444 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  34.63 
 
 
450 aa  238  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  34.63 
 
 
450 aa  238  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  35.21 
 
 
451 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  34.76 
 
 
444 aa  237  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  35.24 
 
 
456 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  35.96 
 
 
622 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  33.71 
 
 
463 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  34.07 
 
 
460 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  35.32 
 
 
441 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  35.47 
 
 
448 aa  226  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  34.99 
 
 
444 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  35.78 
 
 
627 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  33.26 
 
 
448 aa  224  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  33.41 
 
 
435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  34.63 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  34.66 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  34.59 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  35 
 
 
448 aa  220  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  30.56 
 
 
473 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  33.63 
 
 
463 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  32.75 
 
 
525 aa  219  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  33.33 
 
 
464 aa  217  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  33.63 
 
 
444 aa  217  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  35.24 
 
 
442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  33.33 
 
 
444 aa  213  7e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  32.97 
 
 
473 aa  213  9e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  35.75 
 
 
625 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  33.26 
 
 
522 aa  208  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  31.29 
 
 
442 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  32.13 
 
 
434 aa  208  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  32.8 
 
 
439 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  34.99 
 
 
449 aa  207  4e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  33.11 
 
 
418 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  32.11 
 
 
438 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  31.36 
 
 
437 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  31.36 
 
 
437 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  32.49 
 
 
438 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  32.49 
 
 
438 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  32.49 
 
 
438 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  31.36 
 
 
437 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  31.36 
 
 
437 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  31.36 
 
 
437 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  32.18 
 
 
438 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1795  manganese transporter NRAMP  30.82 
 
 
532 aa  203  6e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  33.41 
 
 
442 aa  203  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  32.49 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  30.16 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  32.72 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  31.31 
 
 
439 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  34.15 
 
 
458 aa  201  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  32.27 
 
 
442 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  30.16 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  34.83 
 
 
446 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  30.16 
 
 
438 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  32.1 
 
 
434 aa  197  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  33.7 
 
 
452 aa  196  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  31.88 
 
 
464 aa  196  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  33.11 
 
 
441 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  30.54 
 
 
432 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  29.89 
 
 
436 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  29.89 
 
 
436 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  29.89 
 
 
436 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  31.07 
 
 
445 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  29.48 
 
 
435 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  33.03 
 
 
448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  32.65 
 
 
439 aa  191  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  31.49 
 
 
438 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  32.22 
 
 
434 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1861  Mn2+/Fe2+ transporter  30.87 
 
 
530 aa  188  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  31.12 
 
 
391 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  30.98 
 
 
433 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  29.77 
 
 
433 aa  186  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  31.81 
 
 
431 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  31.74 
 
 
431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  30.3 
 
 
442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  31.42 
 
 
431 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  30.64 
 
 
449 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  31.58 
 
 
431 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  31.58 
 
 
431 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  30.64 
 
 
437 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>