24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32169 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32169  predicted protein  100 
 
 		 1053 aa  2142    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06291  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12360)  27.02 
 
 		 1058 aa  231  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85406  predicted protein  22.97 
 
 		 780 aa  58.5  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  21.52 
 
 		 1454 aa  57  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.08 
 
 		 1652 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.87 
 
 		 676 aa  55.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  21.55 
 
 		 1523 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  26.85 
 
 		 612 aa  51.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.138944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  22.94 
 
 		 443 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  27.39 
 
 		 367 aa  49.3  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.08 
 
 		 596 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.18 
 
 		 1474 aa  48.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.24 
 
 		 1267 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  21.79 
 
 		 696 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  21.38 
 
 		 1193 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  22.75 
 
 		 728 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  24.17 
 
 		 618 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.824291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  29.25 
 
 		 774 aa  45.8  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.29 
 
 		 930 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  19.75 
 
 		 1213 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  24.23 
 
 		 1016 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 		 1878 aa  44.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.03 
 
 		 1626 aa  44.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 1304 aa  44.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>