More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29473 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_29473  predicted protein  100 
 
 
276 aa  563  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00550  tRNA specific adenosine deaminase, putative  38.94 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00012286  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45819  predicted protein  40.79 
 
 
173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0648284  normal  0.202568 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25581  predicted protein  36.99 
 
 
180 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.76196  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  27.59 
 
 
149 aa  75.1  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.58 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  29.85 
 
 
153 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  26.32 
 
 
172 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.65 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  28.29 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  28.47 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  27.48 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.07 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.07 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1476  tRNA-adenosine deaminase  28.95 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.06 
 
 
154 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.16 
 
 
170 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  25.17 
 
 
160 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.95 
 
 
157 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.72 
 
 
166 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.48 
 
 
152 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.11 
 
 
154 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  29.79 
 
 
153 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.11 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0232  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  26.71 
 
 
157 aa  67  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0819594  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  25.79 
 
 
168 aa  67  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  27.04 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  27.04 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  27.04 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  27.04 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  28.76 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10241  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  29.1 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.237232 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.76 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  27.04 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  27.04 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  27.04 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.37 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  27.34 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  26.42 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  26.53 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.37 
 
 
151 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.56 
 
 
161 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.75 
 
 
152 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.46 
 
 
153 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.15 
 
 
167 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.71 
 
 
144 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  25.53 
 
 
166 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  28.57 
 
 
167 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  26.77 
 
 
151 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  26.43 
 
 
174 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16461  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase  27.82 
 
 
163 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  32.33 
 
 
153 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3003  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.08 
 
 
168 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.37 
 
 
148 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  27.81 
 
 
151 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  25.15 
 
 
169 aa  63.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  26.95 
 
 
155 aa  63.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  30.08 
 
 
205 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.73 
 
 
165 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  27.46 
 
 
166 aa  63.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  27.27 
 
 
160 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  29.79 
 
 
165 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  25.49 
 
 
161 aa  62.4  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  25.9 
 
 
172 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  32.06 
 
 
151 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.03 
 
 
151 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  23.6 
 
 
168 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1476  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.34 
 
 
151 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  26.83 
 
 
187 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.39 
 
 
161 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  30.37 
 
 
170 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.56 
 
 
461 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1883  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.56 
 
 
159 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839631  normal  0.641763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  25.9 
 
 
172 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  24.16 
 
 
156 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  26.21 
 
 
176 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  26.95 
 
 
172 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25.17 
 
 
152 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.21 
 
 
181 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.66 
 
 
176 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  30 
 
 
182 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.13 
 
 
187 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  27.81 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  29.93 
 
 
147 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  26.95 
 
 
172 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.67 
 
 
475 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.95 
 
 
154 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  26.95 
 
 
172 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.22 
 
 
162 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  26.83 
 
 
200 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  29.08 
 
 
168 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  25.98 
 
 
179 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  26.79 
 
 
193 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  26.72 
 
 
177 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.2 
 
 
159 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5283  tRNA-adenosine deaminase  27.2 
 
 
159 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.24 
 
 
148 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.57 
 
 
183 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6109  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.2 
 
 
159 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1968  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.2 
 
 
159 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>