58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44014 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44014  predicted protein  100 
 
 
533 aa  1082    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43937  predicted protein  67.95 
 
 
999 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31018  predicted protein  30.85 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.212376  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  29.19 
 
 
198 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 
264 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  31.71 
 
 
200 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  32.39 
 
 
250 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  32.03 
 
 
209 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  27.6 
 
 
238 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  32.03 
 
 
209 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  38.83 
 
 
198 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  35.71 
 
 
203 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 
242 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  25.89 
 
 
225 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  34.15 
 
 
174 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  55.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  34.58 
 
 
207 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  34.58 
 
 
213 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  35.37 
 
 
259 aa  53.5  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 
325 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  28.99 
 
 
149 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  30.6 
 
 
229 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  28.98 
 
 
308 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  31.72 
 
 
229 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  29.59 
 
 
229 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
232 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  30.87 
 
 
320 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  34.51 
 
 
239 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  29.32 
 
 
222 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  26.77 
 
 
185 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  29.25 
 
 
206 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 
232 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  27.04 
 
 
232 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  34.43 
 
 
717 aa  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  27.49 
 
 
242 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  36.61 
 
 
226 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.62 
 
 
705 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  32.33 
 
 
228 aa  47.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  39.39 
 
 
225 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  32.81 
 
 
224 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  29.94 
 
 
224 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  35.29 
 
 
236 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  25.36 
 
 
304 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  35.29 
 
 
236 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  35.24 
 
 
236 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1332  SNARE associated Golgi protein  35.82 
 
 
262 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  35.24 
 
 
236 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 
236 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
224 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.64 
 
 
236 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1430  SNARE associated Golgi protein  35.82 
 
 
262 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.159298  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  35.64 
 
 
236 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  35.24 
 
 
192 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  35.29 
 
 
236 aa  43.9  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  27.78 
 
 
623 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  31.94 
 
 
199 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0516  SNARE associated Golgi protein  27.34 
 
 
182 aa  43.9  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>