33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31018 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31018  predicted protein  100 
 
 
444 aa  885    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.212376  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44014  predicted protein  30.85 
 
 
533 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  28.87 
 
 
229 aa  60.1  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  28.93 
 
 
238 aa  57  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  25.89 
 
 
242 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  28.76 
 
 
264 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.57 
 
 
236 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  29.14 
 
 
236 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  29.14 
 
 
236 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  26.52 
 
 
239 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  25.88 
 
 
304 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 
265 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
236 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  28.57 
 
 
236 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  23.35 
 
 
209 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  26.42 
 
 
229 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  28.95 
 
 
242 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  22.91 
 
 
209 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.89 
 
 
705 aa  47  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  28.7 
 
 
282 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  28.7 
 
 
282 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 
258 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.65 
 
 
722 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  31.75 
 
 
174 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  25.95 
 
 
239 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.12 
 
 
717 aa  43.9  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  29.03 
 
 
266 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  22.93 
 
 
249 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  26.06 
 
 
738 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>