18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22367 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_22367  CULlin protein 3  100 
 
 		 762 aa  1585    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264277  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03939  SCF ubiquitin ligase subunit CulC, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08220)  34.29 
 
 		 823 aa  412  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00875329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  33.59 
 
 		 786 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.365007 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04610  ubiquitin-protein ligase, putative  33.67 
 
 		 808 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  33.73 
 
 		 702 aa  348  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29317  CULlin protein 1  31.4 
 
 		 741 aa  332  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291642  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  29.17 
 
 		 745 aa  328  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36569  predicted protein  93.98 
 
 		 166 aa  322  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  31.36 
 
 		 880 aa  319  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01019  SCF ubiquitin ligase complex subunit CulA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12960)  30.56 
 
 		 764 aa  311  2.9999999999999997e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01140  ubiquitin-protein ligase, putative  30.15 
 
 		 775 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29770  ubiquitin ligase (cullin) of SCF involved in cell cycle control  26.85 
 
 		 776 aa  250  7e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51711  predicted protein  26.6 
 
 		 736 aa  242  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00408227  normal  0.0250071 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44571  CULlin protein 4  27.17 
 
 		 821 aa  202  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.457132  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04260  ubiquitin-protein ligase, putative  33.93 
 
 		 811 aa  190  8e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229428  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80515  cullin, ubiquitin ligase activity  23.82 
 
 		 783 aa  114  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.205176 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47273  predicted protein  21.39 
 
 		 767 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.662856  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44236  predicted protein  22.28 
 
 		 866 aa  50.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963613  normal  0.0380429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>