17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01140 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_01019  SCF ubiquitin ligase complex subunit CulA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12960)  47.66 
 
 		 764 aa  699    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01140  ubiquitin-protein ligase, putative  100 
 
 		 775 aa  1618    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29770  ubiquitin ligase (cullin) of SCF involved in cell cycle control  35.19 
 
 		 776 aa  486  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22367  CULlin protein 3  30.15 
 
 		 762 aa  306  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264277  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29317  CULlin protein 1  28.32 
 
 		 741 aa  302  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291642  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  30.66 
 
 		 702 aa  289  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  28.73 
 
 		 786 aa  276  8e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.365007 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  28.44 
 
 		 745 aa  266  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03939  SCF ubiquitin ligase subunit CulC, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08220)  26.57 
 
 		 823 aa  223  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00875329  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  25.79 
 
 		 880 aa  211  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04610  ubiquitin-protein ligase, putative  25.48 
 
 		 808 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51711  predicted protein  23.32 
 
 		 736 aa  181  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00408227  normal  0.0250071 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44571  CULlin protein 4  30.2 
 
 		 821 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.457132  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04260  ubiquitin-protein ligase, putative  28.85 
 
 		 811 aa  157  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229428  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01120  expressed protein  33.03 
 
 		 241 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80515  cullin, ubiquitin ligase activity  28.49 
 
 		 783 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.205176 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36569  predicted protein  30.77 
 
 		 166 aa  65.1  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>